>RF00004|AtGC=0.447422212128|MR=0.88,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=208,CL=193,SR=0.295336787565,CGCC=0.113989637306
...(((.((((....)))).))).....................((((((........)))))).(((((((...)))))))..............................((((((((.....(((((...)))))....))))))))..((((((.((((((...........))))))..))))))...
NNNTCTNNGCNNNNTGGCTNAGATCAANNTGTAGTANCTGTTCTTNTCAGNNTNANNNCTGNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNANNNNNNTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTNGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
>RF01709|AtGC=0.362432564983|MR=0.79,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=38,CL=34,SR=0.294117647059,CGCC=0.117647058824
((((((((((((..........))))))))))))
NNNNNNNNNNNGANNTATTGTCCNNNNNNNNNNN
>RF00736|AtGC=0.446608315098|MR=0.95,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=56,CL=67,SR=0.283582089552,CGCC=0.089552238806
..((((((..(((((((.((((((....)))))).)))))))..)))))).................
NNNNTNTNTNNNNNGTTNTNCNNNNANTNNNGAAAANCTNNNNNGNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
>RF00263|AtGC=0.495925494761|MR=0.93,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=26,CL=132,SR=0.257575757576,CGCC=0.106060606061
.((((((((..........((((((((((......)))))))))).....)))))))).........(((((((.....(((((((((((.........)))))))))))........))))))).......
NNNNCANNNNAACNCNANNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNANANNANNNNNNNNTNNTCNCCTTTNNNNNGCNNNNNNNNNGNNNNNNNNAGTGAANNNNNANGNNNNACANNN
>RF01045|AtGC=0.412836079792|MR=0.92,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=24,CL=97,SR=0.288659793814,CGCC=0.103092783505
(((........(((...((((.((((((((((((((((((((................))))))))).))))))))))).))))..)))))).....
NNNNNNNNNNNNNCNNNNNNANCTTNNTANAANNCAGANTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNANTCTNNANTTNTNNCNNGNNNNNNNGNGNNNNNNNN
>RF00103|AtGC=0.390359541683|MR=0.99,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=66,CL=72,SR=0.263888888889,CGCC=0.111111111111
.....((((((((((((((((((.((.(((..............))))).))))))))))))))))))....
NNNNNNNNCNNNCTNNNTNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGAANGNNANGAAGTNTGNNNNNNN
>RF00406|AtGC=0.556303116147|MR=0.96,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=21,CL=137,SR=0.204379562044,CGCC=0.0875912408759
((((((((......((((((.(((((.........)).))).))))))..)))).))))............((((((.....((...((((((((..........))))))..))...))....)))))).......
NNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNGNNNNNNNNCNNTNGNNNTNNNNTAGNNNNNNNNTGCNANNGNANNNNNNNNCNNNNAACCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNGAANNNNGNNNNANNNNN
>RF00545|AtGC=0.412410926366|MR=0.96,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=24,CL=144,SR=0.243055555556,CGCC=0.0972222222222
((((((..((..((((((((((.((...........))))))))).)))....))..)))))).....(((..(((.(((.((....((.((((((((.((...........)).)))))))).))...))))))))...))).
NNNNNNGCACTCTGTNNCNCANNNNNNNNNNNNNNNNCNTGTGANNACAATTTNNNANNNTGCNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNTTNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNN
>RF01873|AtGC=0.31426016987|MR=0.96,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=21,CL=107,SR=0.214953271028,CGCC=0.0280373831776
((((((((....(((((((.....................)))))))..)))))))).(((......(((((....)))))...................)))....
TNNNNNTNNNTNNNNNNNNNNNNGNTNACNNNAANNNNATTNNNNANNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNANTAACTTNNNNNNNNNNANNNNNN
>RF00617|AtGC=0.435137138621|MR=0.92,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=59,CL=45,SR=0.288888888889,CGCC=0.0666666666667
.............((.((((((........)))))).))......
NNNNANNAACNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAATATG
>RF00451|AtGC=0.433645589383|MR=0.96,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=25,CL=112,SR=0.241071428571,CGCC=0.0982142857143
....(((((.(((((((((((((((((((((((((..........................................))))))))))))))))))))))))).)))))....
NNNTNNNNNNGAGTTNNNNNANNCNCTTNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAGTGNTTGNNGNNACTCNNNNNNNNNN
>RF00670|AtGC=0.442582247052|MR=0.9,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=20,CL=81,SR=0.222222222222,CGCC=0.0617283950617
...((((((((((...((((((((((..((((((((.(.......)))))))))..))))))))))..))))))))))...
NNNNNNNNNNNGTNAANTGNTCNNNNNNNNNNNNTNNNNNNTNNTNNACNNNNNNNNNNTNANNATNNNCNNNNNNNNNNN
>RF00007|AtGC=0.526120896717|MR=0.86,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=62,CL=163,SR=0.282208588957,CGCC=0.110429447853
.(((((..........)))))........((((((((......))))))))....(((((.......)))))..........................(((((..(((((((.((..(((((.(((((........))))).))))).)).))))))))))))
GCCTNAAACTNATGAGTAAGGAAAANANNNNNNNNNGNTNNCNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTNTGNNNNNNNNNNNGNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNTACTTTNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNN
>RF00951|AtGC=0.280298321939|MR=0.94,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=31,CL=52,SR=0.25,CGCC=0.0
.....(((((((.(((.(((((........).)))).))).)))))))....
NNNNNNNNNNANNTNNNTNNNNNNNNNNNTNNNNNANATANNTATNNTANNN
>RF01694|AtGC=0.428874734607|MR=0.95,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=40,CL=86,SR=0.255813953488,CGCC=0.0581395348837
...................(((..(((((((((....))))))))).....)))..(((((((......)))))))..........
NTGCNNANNNNCTNANNNNNNNNNTTNNNNTATGNGAATANNNTNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNANANNNNNNNNN
>RF00424|AtGC=0.507214369847|MR=0.92,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=37,CL=186,SR=0.263440860215,CGCC=0.112903225806
..((((.(((....((((((((.(((((((.(((...........))).)))))....)))))).))))...))).))))...........((((((((.....))))).))).......(((((((((.((....(((.((((..(((....))).)))).)))....)).))))))))).....
NNNNNCNNNNNANNGGCTNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNCNGNNNNCNNNANNNNGNCNNANANNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCANTAACAGNTGTNNNCATNNNNGNNGNANNNTNNTGNTCATNNATNNNANNNNANANANNN
>RF01692|AtGC=0.340204081633|MR=0.69,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=38,CL=122,SR=0.295081967213,CGCC=0.0819672131148
..............................(((..((((((((.((((...((.(((.((((.(((....))).))))))).)))))).))))))))..)))....................
NNNNNNNNNNNNNNNNNANNANNANNNNNANNANANTANNTNNTNNTGGNNNNNNNNNNNNNNACNNNNANNTCGTNNNNNNNNNNNNNNTNTNTANNATNNNNNNNNNNNAAAGGCNTGTC
>RF00708|AtGC=0.315597287428|MR=0.96,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=21,CL=91,SR=0.21978021978,CGCC=0.0879120879121
......(((.(((((((...(((((.((((((((((((((.........)))))))))))))).)))))...))))))).)))........
NNNNGNNNNNNNNNTNTNTNNGNNNTNNGTTCNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGGNNNNNTTNGNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNN
>RF02108|AtGC=0.344855967078|MR=0.96,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=21,CL=58,SR=0.224137931034,CGCC=0.0344827586207
.((((......))))(((((((..........)))))))...................
NTNNNNNNNTNNNNNNNNGNNNNNTNTNNNNTNNTCTTNATNNNNNNNNTNNNNNNNN
>RF00561|AtGC=0.348361803416|MR=0.97,CR=0.3,SRC=0.3,MAS=20,AS=28,CL=127,SR=0.299212598425,CGCC=0.110236220472
(((((((((.(..((((((((....(...).))))))))....).)))))))))........(((((.(((((.....((((((((((........)))))))))).......))))).)))))...
NNNANNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNGNNCNNNNANNAANNNNTCNTTNGCAACCNNNANNNCNTNGNNNNGNATGAGNTNTNNTNCANNNNNNNANGNANANN