src/ell/LT_AutoFlood.hh

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00001 #ifndef LT_AUTOFLOOD_HH_
00002 #define LT_AUTOFLOOD_HH_
00003 
00004 //##############################################################################
00005 //##############################################################################
00006 
00007 #include "ell/LandscapeTopology.hh"
00008 #include "ell/Basin.hh"
00009 
00010 namespace ell
00011 {
00012 
00013 
00035     class LT_AutoFlood : public LandscapeTopology
00036     {
00037     protected:
00038         
00040         LandscapeTopology* lt;
00041         
00044         double maxFloodHeight;
00045 
00048         const double floodDeltaE;
00051         const size_t floodMaxToStore;
00052         
00055         const bool deleteLT;
00056 
00057     public:
00058         
00070         LT_AutoFlood(   LandscapeTopology * lt
00071                         , const double floodMaxHeight
00072                         , const double floodDeltaE
00073                         , const size_t floodMaxToStore
00074                         , const bool deleteLT = false );
00075         
00076         virtual ~LT_AutoFlood();
00077         
00083         virtual 
00084         bool 
00085         addSaddle(const size_t i, const size_t j, const State* const s);
00086         
00092         virtual 
00093         bool 
00094         addSaddle(const State* const m_i, const State* const m_j, const State* const s);
00095         
00107         virtual 
00108         const size_t 
00109         addMin(const State* const m);
00110         
00115         virtual 
00116         const size_t 
00117         getMinIndex(const State* const m) const;
00118         
00121         virtual 
00122         const size_t 
00123         getMinCount() const;
00124         
00128         virtual 
00129         const State* const 
00130         getMin(size_t i) const;
00131         
00136         virtual 
00137         const State* const 
00138         getMFEState() const;
00139 
00143         virtual 
00144         double 
00145         getDistance(const LandscapeTopology* const lt) const;
00146         
00149         virtual 
00150         void 
00151         sort();
00152 
00155         virtual 
00156         bool 
00157         isSorted() const;
00158 
00160         virtual 
00161         void 
00162         clear();
00163 
00168         virtual 
00169         void
00170         write(  std::ostream & out, 
00171                 const bool writeGraph = false ) const;
00172 
00182         virtual 
00183         std::pair<int,std::string>
00184         read(   std::istream & in, 
00185                 const State * const templateState  );
00186 
00187     };
00188 
00189 } // namespace ell
00190 
00191   // inline method definitions
00192 #include "LT_AutoFlood.icc"
00193 
00194 
00195 //##############################################################################
00196 //##############################################################################
00197 
00198 #endif /*LT_AUTOFLOOD_HH_*/