Reference sequence (1): Cthe5_A_G_4_M9_F10
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70% and property
                              1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .  ] 443
1 Cthe5_A_G_4_M9_F10 100.0%     ttttcctgctattttctgtcttattatgcttttggattgaaacaacgacttctgttaaa------------tttggaaattaaactctacttttcttaaatgaaatat--aataaaaaagcttaatttataaaactttaaagaatgctgtcaacgaaatggaattccaaattgtaatatttgttgaaaagattattagtttatgatatatataagttgtaa-gttggattgtgagtggaaaaatgtggctgcaaaattattggaaaatttgaagtgatgggcttgtaaatcttgaaaatggcgggtttgaagcctatgttggtgactgaaaaatgggtggaatttgataaaaatcgactattttttgatgaaaaatgtgcaaaaaagtttcgtcaaaaaaatcttgtaggctttgaaaatggcgggatttgacttcgaggact    
2 Ccla_A_G_5_M9_F10   55.0%     aaatagagttctttttgataaaagcagaagtggacagggcaac-----------taaagtgttgacggagtatagggatataaagcctgtatttgtaaatgcaattaaggagcagaacaggatattggaggaaagccttgaaaaaatcaggagatttatggaggaatagg--aacagagaagttgaatatatagttaaattgtgatatgttaaaaatgaaa--gagatgggtatatggaaatatgtggatgcaaaattattgggaaatttgaagtcacaggcttgtaagtattgaaatttgggggttataagcttgtgttgatgattaaaaaatgtgattttttatatgaaaaaattgtgttttgcaataaaattagctcaaaaaaagtccgtcaaaaaaagcttgtaaggcttgaggtatgaaggattaagcttcgcggact    
3 Cthe_B_G_1_M9_F10   55.1%     tatttttgctcatggttatgaatttattagtaaagaaaagtataatgaatttaaaaaagtggttgaagattatatgaacttgttgtgttctatagaaggaatagataa--agaagaactgtttgattcatgcgagtttataaagctatagccgagagttaatatgattaa-agaataaggtgttgaaattaaaaccagattatgttatgttttaattaaagtgataagtaacattttacaaaatgtggatacaaaattattgagaattttgagttcatgttcgttaaagccttggaaatagtggtatggaagcttatgttgatagcaaaaaattgaatgaaaaatggtggattttaggagaattttgataaaatatgaccaaaaaagttcagtcaaaaaaatcttgtaagcattgacatttaagcaatatcacctcgaggact    
  consensus/90%                 sssTsssGsTssTssssuTssssssAssssTssusAssussAs...........ssAAu............sTssGuAssTusssssTssssTssssuusssAusTAs..AusAuAAssGssTusTssAsusuAsssTssAuAussssusssusssssTuususssssuu..ussssAsssGTTGAAsssAssussAusTTuTGsTATuTsssAusTusAu..ssuusssusussTsusAAsATGTGGsTuCAAAATTATTGuuAAsTTTGAusTsAsussCsTssAAussTTGuAAsTsGsGGssTssAAGCsTuTGTTGuTuussuAAAAsTGsusssssssssuTuuAssssssssussTTssuATuAAAsssGssCAAAAAAusTssGTCAAAAAAAsCTTGTAuGssTTGAsusssususuATsssuCsTCGsGGACT    

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