Reference sequence (1): Ahae1_A_G_3_M1_F1
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70% and property
                             1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .       ] 378
1 Ahae1_A_G_3_M1_F1 100.0%     gcagtacgg-----------aaaggaagatgatgtttgcagtagtaactttgactgcggctcctgatcatttacacgggtatttgaacagattcctcacagaagtagatagtggtatttatgtaggaaatatttctcgagccgtttgtgaaaaattgtgggaaagaatcggagaagttccttttaacggaaatgcaaatataatttatagcgacaacacgagagaacaggggttttcagtgaaaactaaaggacgcaccgcgtgcgacattgttgatctagatggagctatccttatctccaatcgtgttgcgcgcggtgaacaaaaac-tccgttacaa-----------ccgctgaaaaagcgcaggtcagttagt    
2 Cglu_B_G_4_M1_F1   55.3%     ccaatacggcagctaaatttaaggtagaaatatgtttctcgtcatcgtgtctcgatcattaccagaccacctgagtggttacttgagtagatttctgtcagaagtagataccggggtttttgttggcaacgtatcaagaagagttagagataacttgtggaaacgttgcggacaagcccttaaatccggaagtttgacaatgataaataatgatccgtcccgagaacaggggtttgctgttaacacaatggggccacgaagacgtaatatcattgatatggatgg-gcttttattggtttctaccttatcgtctgcgatcgccaaaaacgaccgcaacga-----------ttcctaaaaga--ccagttcagggagt    
3 Cdip_A_G_4_M1_F1   54.7%     acagtatggcaagg------agattaactagatgttcgctgtactttaccttcaggcagcacctgatcatctccttggttacgtcacccgtttccttactgaagcggatacaagcatctatgttggaaatgtttccaaaaacgtagcttcaaacttatggattcgtgtaacagaagctattaaagatgctcatgccacaatgattgtgagcgataattctcgtgagcaaggtttctcaataatgacgacaggtgatagcacactacaagttcttgatgcagatgg-gttatccgt--------cctggcttcacgccctggacga-----gccgctgtaaaattacatggcctacagtaaaactgcagtacagttagt    
  consensus/90%                sCAuTAsGG...........AuussAussssATGTTssssGTssTsssssssssssCusssCCsGAsCAssTssssGGsTAssTsAsssGsTTsCTssCsGAAGsuGATAssuGsuTsTsTGTsGGsAAsuTsTCssuAussGTsssssssAAsTTuTGGusssGssssusAsAAGssssTssssssGsssuTsssAssATuATssssAusGAsssssCssGsGAuCAuGGsTTssCsuTsAssACsAsuGGsssssssusussssAsuTssTTGATssuGATGG.GsTsTsssT........sCssussssssGCssTsusCuA.....sCCGssusuA...........sssCsusAAuA..sCAGssCAGssAGT    

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