Reference sequence (1): Mign_A_G_1_M9_F10
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                                1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .] 441
 1 Mign_A_G_1_M9_F10   100.0%     tgcttttataaagggggttgtggattttggtatta--------------gaaaattggaaaaaagtattac---------------------tga--------------------ttttttcaaattaaaattgaggttttttaattatttta--------gttttttggttttattttgtatgttttaagtttggattggttttaaattgtgtaatatctctgctaattattgagatttattggcgtggttgtgcattggatttataaataatttgcacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttata-aagggtttgataatcatacagtaagaaaattcgggttgaaaaagaaagatttatataggagtttaggtataaaataaggatgaagttatagg    
 2 Mign_G_15_M9_F10     91.5%     tgcttttatataccccctgttgaattttggtacta--------------gaaaattggaaaaaagtattac---------------------tga--------------------ttttttcaaattaaaattgagattttttaattatttta--------gttttttggttttattttgtatgttttaagtttgagttggttttggattgtgtaaaatctctgctaattattgagatttattggagtggttgtgcattggatttataaataatttgcacaatctttcttactc-------------------------------------------------ttata-aaggtttcaataattatgcagtaagaaaattcagttacaaaaagaaagatttatataggagtttgggtataaaataaggatgaagttatagg    
 3 Mign_A_G_15_M9_F10   91.5%     tgcttttatataccccctgttgaattttggtacta--------------gaaaattggaaaaaagtattac---------------------tga--------------------ttttttcaaattaaaattgagattttttaattatttta--------gttttttggttttattttgtatgttttaagtttgagttggttttggattgtgtaaaatctctgctaattattgagatttattggagtggttgtgcattggatttataaataatttgcacaatctttcttactc-------------------------------------------------ttata-aaggtttcaataattatgcagtaagaaaattcagttacaaaaagaaagatttatataggagtttgggtataaaataaggatgaagttatagg    
 4 Mign_A_G_8_M9_F10    93.9%     tgcttttatataccccctgttgaattttggtacta--------------gaaaattggaaaaaagtattac---------------------tga--------------------ttttttcaaattaaaattgagattttttaattatttta--------gttttttggttttattttgtatgttttaagtttgagttggttttggattgtgtaaaatctctgctaattattgagatttattggagtggttgtgcattggatttataaataatttgcacaatctttcttactc-------------------------------------------------ttata-aagggtttgataatcatacagtaagaaaattcgggttgaaaaagaaagatttatataggagtttgggcataaaataaggatgaagttatagg    
 5 Mign_A_G_16_M9_F10   89.6%     tgcttttataaaggggttgttgaattttggtacta--------------gaaaattgggaaaaagtattac---------------------tca--------------------ttttttcaaattaaaattgagatttttggaagattttt--------gttggttgtttttatttttgtagttttaagtttggattggttttggattgtataatatctctgctaattattgagatttattggtgtggttgtgcgttggatttataaataatttgcacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttata-aaggtttcaataattgggcagtaagaaaaatagggttgaaaaagaaagatttatataggagtttaggtataaaataaggatgaagttatagg    
 6 Mign_A_G_6_M9_F10    77.0%     --------------------------------------------------------gggaaaaagtattac---------------------taa--------------------ttttttcaaattaaaattgagatttttgggagatttta--------gttatttgtttttatttttgtagttttaagtttggattggttttggattgtataatatctccgctaattattgagatttattggagttgttgtgcattggatttataaataatttgcacaatctttcttacttcctccgagcgaagcgaggagggattaaaaacccgttagggtttttaagattata-aaggttttaataatcatgcagtaagaaaaatcatgttgaaaaagaaaaatttatataggagtttgggtataaaataaggatgaagttatagg    
 7 Mign_G_6_M9_F10      77.0%     --------------------------------------------------------gggaaaaagtattac---------------------taa--------------------ttttttcaaattaaaattgagatttttgggagatttta--------gttatttgtttttatttttgtagttttaagtttggattggttttggattgtataatatctccgctaattattgagatttattggagttgttgtgcattggatttataaataatttgcacaatctttcttacttcctccgagcgaagcgaggagggattaaaaacccgttagggtttttaagattata-aaggttttaataatcatgcagtaagaaaaatcatgttgaaaaagaaaaatttatataggagtttgggtataaaataaggatgaagttatagg    
 8 Mign_A_G_25_M9_F10   64.2%     tttttttattttagagaggattagaattgataaaaagattacttggtatgagtttagaagagaactaaaccgaatagccgttgggaatgctataa--------------------tctctttatgtaaagaagctggtttattgttaatctaa--------gtatttaaatgtatttgcgaaagtccta----------------------------atctcttctaatcattgagatttattggagtggttgtgcattggatttataaataatttgcacaatctttcttactc-------------------------------------------------ttata-aagggtttgataatcatacagtaagaaaattcgggttgaaaaagaaagatttatataggagtttgggcataaaataaggatgaagttatagg    
 9 Minf1_A_G_12_M9_F10  73.3%     tgcttttatataggggtcgttggaaattggtacga--------------gaaaattggggaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagtttgttgg--------attgtttgctgttattttata-gtattaggtttaattggactttatttttggttaaataagggttaattgttgagctttgtttttacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataaccaaccagtaagaaaactcaggttaaaaaagaaagttttttataggagttttgatataaaataaggacagacattaagg    
10 Minf_G_12_M9_F10     73.3%     tgcttttatataggggtcgttggaaattggtacga--------------gaaaattggggaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagtttgttgg--------attgtttgctgttattttata-gtattaggtttaattggactttatttttggttaaataagggttaattgttgagctttgtttttacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataaccaaccagtaagaaaactcaggttaaaaaagaaagttttttataggagttttgatataaaataaggacagacattaagg    
11 Minf1_A_G_7_M9_F10   73.3%     tgcttttatataggggttgttggaaattggtacga--------------gaaaattgggaaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagtttgttgg--------attgtttgctgttattttattggttttaggtttaattagactttatttttagtgaaataagggttaattgctgagctttgttttaacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataaccaaccagtaagaaaactcgggtttaaaaagaaagttttttataggagtttcgatataaaataagagcagacattaagg    
12 Minf_G_7_M9_F10      73.3%     tgcttttatataggggttgttggaaattggtacga--------------gaaaattgggaaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagtttgttgg--------attgtttgctgttattttattggttttaggtttaattagactttatttttagtgaaataagggttaattgctgagctttgttttaacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataaccaaccagtaagaaaactcgggtttaaaaagaaagttttttataggagtttcgatataaaataagagcagacattaagg    
13 Minf_G_3_M9_F10      74.5%     tgcttttatatagaggttgttggaaattggtacga--------------gaaaattgggaaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagtttgttgg--------attgtttgctgttattttattggttttaggtttaattagactttatttttagtgaaatatgggttaattgttgagctttgttttaacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataatcaaccagtaagaaaactcgggtttaaaaagaaagttttttataggagttttgatataaaataaggacagacattaagg    
14 Minf1_A_G_3_M9_F10   74.5%     tgcttttatatagaggttgttggaaattggtacga--------------gaaaattgggaaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagtttgttgg--------attgtttgctgttattttattggttttaggtttaattagactttatttttagtgaaatatgggttaattgttgagctttgttttaacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataatcaaccagtaagaaaactcgggtttaaaaagaaagttttttataggagttttgatataaaataaggacagacattaagg    
15 Minf1_A_G_5_M9_F10   75.4%     tgcttttatataggggttgttggaaattggtacga--------------gaaaattgggaaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagttttttgg--------cttgtttgctgttattttgtaggttttaggtttagttagactttatttttagtgaaatatgggttaattgttgagctttgttttaacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataaccaaccagtaagaaaactcgggtttaaaaagaaagttttttataggagttttgatataaaataagggcagacattaagg    
16 Minf1_A_G_11_M9_F10  74.8%     tgcttttatataggggttgttgaaaattggtacga--------------gaaaattggggaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagttttttgg--------tttgtttgctgttattttatatgttttaggtttagttaggagttgtttttagtgaaataagggttaattgctgagctttattttaacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataatcaaccagtaagaaaactcgggtttaaaaagaaagttttttataggagttttgatataaaataaggacagacattaagg    
17 Minf_G_11_M9_F10     74.8%     tgcttttatataggggttgttgaaaattggtacga--------------gaaaattggggaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagttttttgg--------tttgtttgctgttattttatatgttttaggtttagttaggagttgtttttagtgaaataagggttaattgctgagctttattttaacggttgtgcatagtatttttaaatggagggaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataatcaaccagtaagaaaactcgggtttaaaaagaaagttttttataggagttttgatataaaataaggacagacattaagg    
18 Minf1_A_G_4_M9_F10   73.6%     tgcttttatataggggttgttggaaattggtacga--------------gaaaattgtggaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagttttttgg--------tttatttgctgttattttatatattttaggtttaattagactttatttttagtgaaataagggttaattgttgagctttgttttaatggttgtgcatagtatttttaaatggaggaaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataatcaaccagtaagaaaactcaggttaaaaaagaaagttttttataggagtttcgatataaaataagagcagacattaagg    
19 Minf_G_4_M9_F10      73.6%     tgcttttatataggggttgttggaaattggtacga--------------gaaaattgtggaaaagtaatac---------------------tga--------------------ttttttcgttggagaattgtgattttttagttttttgg--------tttatttgctgttattttatatattttaggtttaattagactttatttttagtgaaataagggttaattgttgagctttgttttaatggttgtgcatagtatttttaaatggaggaaacaatctttcttactt-------------------------------------------------ttatataggggttcaataatcaaccagtaagaaaactcaggttaaaaaagaaagttttttataggagtttcgatataaaataagagcagacattaagg    
20 Mign_A_G_12_M9_F10   42.0%     aaatctcttaaactaattctaaaaatgtgttttattattagagtagctatatattcattgtaacttatagc---------------------taaaggccttcctactttgcgtttttctttatatggaagtaaaatatttataataaatgaaacaaaatcataagtgtacttaatattgaatatcttaaacct------------------------------cttatcgt--aggctttccagtatccttttcttttggtttttc---tgccgctcataattattattacta-------------------------------------------------ttatttatagtattcgtatttttc-------gacaacctcctaaaaaaagaaacatttatataggagttcgggcataaaataaggacagaagttaagg    
   consensus/90%                  sssTsTssTsssssssssssssuusssTGsTssss..............sAsssTsGsuuAAAAGTAsTAC.....................TuA....................TTTTTTCussssAuAATTGsGuTTTTTsuussssTTsu........sTTsTTTGsTsTTATTTTssssuTsTTAuGTTTuusTsGussTTussTTssuTsAsATssssGsTAATTusTGAGsTTTuTTsssussGTTGTGCATsGsATTTsTAAATuusssusACAATCTTTCTTACTs.................................................TTATA.AuGGsTTsuATAAssAssCAGTAAGAAAAsTCussTssAAAAAGAAAusTTTsTATAGGAGTTTsGusATAAAATAAGuusuuAssTssAGG    

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