Reference sequence (1): Mvul_G_4_X_F4
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70% and property
                              1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :    ] 355
 1 Mvul_G_4_X_F4     100.0%     ttagatttttgttttttatttg-gttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattgttttgtatatt---tggatgtgtttgattatggagtttt---------tttgaagtttttagttatttgtagttgtttttagaaatcc--------acggttgattaagtgtgttttatgtttttattttctgtttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaaggaaaggggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaatatt-ataatgaaataaggaaaattaccct--    
 2 Mvul_A_G_4_X_F4   100.0%     ttagatttttgttttttatttg-gttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattgttttgtatatt---tggatgtgtttgattatggagtttt---------tttgaagtttttagttatttgtagttgtttttagaaatcc--------acggttgattaagtgtgttttatgtttttattttctgtttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaaggaaaggggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaatatt-ataatgaaataaggaaaattaccct--    
 3 Mvul_A_G_10_X_F4   93.1%     ttagatttttgttttttagttg-gtttttgttggtttctgagggttggtttgttttattattttgtatatt---tggatgcttttatttatggagtttt---------tttagagtttttagttatttatagttgtttttagagatcc--------atggttgattaattatattttatgtttttgttttctatttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattacctt--    
 4 Mvul_G_10_X_F4     93.1%     ttagatttttgttttttagttg-gtttttgttggtttctgagggttggtttgttttattattttgtatatt---tggatgcttttatttatggagtttt---------tttagagtttttagttatttatagttgtttttagagatcc--------atggttgattaattatattttatgtttttgttttctatttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattacctt--    
 5 Mvul_A_G_12_X_F4   93.7%     ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctaagggttggtttgttttattgttttttatatt---tggatgtgtttgattatggagattt---------tttagagtttttagttatttgtagttgtttttagaaatcc--------acggttgattaagtgtgttttttgtttttatattttatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaagaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaacgta-ataatgaaataagaaaaattgtcct--    
 6 Mvul_A_G_9_X_F4    91.5%     ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtatttaattatggagattt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttaaaaatcc--------atggttgattaagtgtgttttttgtttttatgttttatttat------tgttgttttttaaataaaagttcgaattgttttgttatagggtt------tataaagaagaggggttatctatgggtagaagttttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgccct--    
 7 Mvul_G_9_X_F4      91.5%     ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtatttaattatggagattt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttaaaaatcc--------atggttgattaagtgtgttttttgtttttatgttttatttat------tgttgttttttaaataaaagttcgaattgttttgttatagggtt------tataaagaagaggggttatctatgggtagaagttttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgccct--    
 8 Mvul_G_2_X_F4      91.2%     ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctgagggttggtttgtttaattgtttcttatatt---tagatgtgtttgattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttatagttgtttttagaaatcc--------acggttaattaagtgtgttttttgtttttgttaattatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgtcct--    
 9 Mvul_A_G_2_X_F4    91.2%     ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctgagggttggtttgtttaattgtttcttatatt---tagatgtgtttgattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttatagttgtttttagaaatcc--------acggttaattaagtgtgttttttgtttttgttaattatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgtcct--    
10 Mvul_A_G_7_X_F4    91.5%     ttagatttttgttttttatttgttttttagttggtttctgagggttggtttgttttattattttatatatt---tggatgtatttaattatggagattt---------tttagagtttttaattatttgtagttgtttttagaaatcc--------acggttaattaagtgtgttttttgtttttgttaattatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaagaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaataccagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaagattgccct--    
11 Mvul_A_G_21_X_F4   91.8%     ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctaagggttggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtgtttgattatagggattt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttaaaaatcc--------atggttgattaagtgtgttttttgtttt------ctatttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggagttatctatgggtagaaaaattatagtgtagaaaaatataaatataagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattaccct--    
12 Mvul_A_G_14_X_F4   90.9%     tagatttttgtttttttatttgttttttagttggtttctgaggggtggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtatttaattatggagtttt---------tttagagtttttaattatttgtagttgtttttaaaaatcc--------acggttagttaagtgtgttttttgtttttatattttatttat------tgttattttttaaataaaagtttggattgttttgttatagggtt------tataaagaaaagaggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatataagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattaccct--    
13 Mvul_A_G_20_X_F4   90.6%     ttagatttttgttttttatttg-gtttttgttggtttctaaggggtggtttgtttaattattttgcatatt---tggatgtatttgattatggagtttt---------tttagagtttttaatttattgaagttgtttttagaaatcc--------atggttgattaagtgtgttttttgtttttatttgtttttagt------tgttgttttttaaataaaagtttggattgttttgttatagggtt------tataaagaaaagaggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaatatt-ataacaaaataagaaaaattatcct--    
14 Mvul_A_G_16_X_F4   87.1%     tatattttgtgttttttatttgttttttagttggtttctgagggttggtttgttttattattttttatatt---tagatgtatttaattatggagattt---------tttagagtttttagttatttacagttgtttttagaaatcc--------atggttgattatttgatctatttatttttattgattatttgc------agttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgccct--    
15 Mvul_A_G_8_X_F4    90.9%     tgaggtttctgttttttatttg-tttttagttggtttcgaatgggtggtttgttttattattttgtatatt---tagatgtgtttgattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttagaaatcc--------atggttgattaattatattttatgtttttatgttttatttat------tgttattttttaaatagaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatttatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacattaataataaaataaaaaaaattatcct--    
16 Mvul_G_8_X_F4      90.9%     tgaggtttctgttttttatttg-tttttagttggtttcgaatgggtggtttgttttattattttgtatatt---tagatgtgtttgattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttagaaatcc--------atggttgattaattatattttatgtttttatgttttatttat------tgttattttttaaatagaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatttatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacattaataataaaataaaaaaaattatcct--    
17 Mvul_A_G_6_X_F4    84.6%     tatattttgtgttttttatttg-gtttttgttgattttgaaggagtggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtatttaattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttagaaatcc--------acgattaattacttgatttacttatttttattaattatttat------tgttgttttttaaataaaagttcgaattattttgttatagggtt------tataaagaaaaggggttatttgggggtaggataattatggtgtggaaaactataaatataagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattaccct--    
18 Mvul_A_G_17_X_F4   70.6%     catctttattgcaaactacgtc-tatataataattatccttggcatg--tatttttatcttgttgtttgtt---tttgtttttttgtgtttttagtttttggtttagatttttgttttttatttgtttttagttggtttctg--------------agggttggttaattatattttatgtttttatattttatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattattttgttatagggtt------tataaagaaaaggggttatttgggggtaggataattatggtgtggaaaactataaatataagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattaccct--    
19 Mjan_A_G_16_X_F4   58.6%     ctgatatcattatttttaacct-tttttatctaatttctaagggtagcttattttaaaaattttatttatt---tggatttgttaaattatagggattt---------ttaaaaaattctacttaattgtttttattttgagatttct--------ccaatgattaatttttattttgaaaatcaaatattttaaaaa--ccaagtttataccatagagaaaagtttaaa---tattggttaatggta------tataaataaaaggtgaaacctacccatcggtaaaatgtgg-gtagtaaaatataaatatcagaaa-gattat--aaaataaatcatctgatatgaccgcct    
20 Mjan_A_G_17_X_F4   54.9%     atttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggttagctggtttgattgtttaaaatatt---tgagtttattgaattattcagattt---------ttaaaaattaggattaattaggtaagtaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--    
21 Mjan_G_17_X_F4     54.9%     atttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggttagctggtttgattgtttaaaatatt---tgagtttattgaattattcagattt---------ttaaaaattaggattaattaggtaagtaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--    
22 Mjan_G_14_X_F4     55.5%     agttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggtttgctggtttgattatttagaatatt---tgagtttattgaattattcagattt---------ttaaaaattaagattaattaggaaaggaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatgcttagttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--    
23 Mjan_A_G_19_X_F4   55.5%     agttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggtttgctggtttgattatttagaatatt---tgagtttattgaattattcagattt---------ttaaaaattaagattaattaggaaaggaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatgcttagttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--    
24 Mjan_A_G_12_X_F4   53.7%     agttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggtttgctggtttgattatttagaatatt---taagtttattgaattattcagattt---------ttgaaaataaaaattaaataattatctaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttgaatttaaaaagataaaaatgcttagttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttacccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--    
25 Mjan_A_G_18_X_F4   55.8%     atctatttcttcatttgagaat-tttttatttaatttctaagggtttgctggtttgattatttagaatatt---tgagtttattaaattatttagattt---------ttaaaaattgagattaattaggtaagtaaataagatttct--------ctaactaataagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatgcttagttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaaatatattatgttgtgaatgattgccct--    
26 Mjan_A_G_3_X_F4    55.2%     ctttatttctttatttaaataa-tatttatttaatttctaagggtttgctggtttgattgtttagaatatt---taacttaatcaaattatttgaattt---------ttgaaaattaggattaattaggcaagtaaataagatttct--------ctaacaaataagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaaatatattatgttgtgaatgattaccct--    
27 Mjan_G_10_X_F4     54.3%     aattatttctttatttaaataa-tatttatttaatttctaagggttagctgatttgattgtttaaaatatt---taacttaattaaattatttagattt---------ttaaaaattaagattaattaggtaagtaaataaaatttct--------ctaacaaataagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatgctcagttttattaaagggagaaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--    
28 Mjan_A_G_10_X_F4   54.3%     aattatttctttatttaaataa-tatttatttaatttctaagggttagctgatttgattgtttaaaatatt---taacttaattaaattatttagattt---------ttaaaaattaagattaattaggtaagtaaataaaatttct--------ctaacaaataagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatgctcagttttattaaagggagaaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--    
29 METH32_G_1_X_F4    53.1%     tggtatttgttaatttagagga-tttaagttcaatttctaagggtctgtaagtttgattatttggaatatt---taggttcattaaattatttagattt---------ttaaaagttaagattgaatagtaagttaaatgagatttct--------ctaactaataagttaaatttttaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatagaaaagcttata------tagtgttggatt------tataaataaaggatgttatttacccttagaaaaa-tatggttccgaaaagcttaaatattagaag-agtgattaaaattatattgtcgatgattgccc---    
30 Mthe5_A_G_7_X_F4   41.9%     tcggggtcctttcgttcagtcg-tttatgagccatttttcagcatcccattataataacataatgttattt---taagcttctttcaggattaaaggtt---------ttattatcaacctgatggttttttatcctgccaaaattct--------ttttaaattgatttaaatactttaaatgtcttatttatggat--------------------------tttaataccttctgttaagtcgtctatccatataaatagaatgcattttctg-ggatcgacaaatttatatgtctgaaaggagaaatttcaa----agcgatagaggtcaaatgaagaaaaaatccgccct    
31 Mthe5_A_G_16_X_F4  42.2%     ttggagcccattcgtccagtcg-tttatgagccatttttcagcttcctgttataataacttgatgttattt---taagcttctttaaggattagaggtt---------ttaatatcaattatatgattatttatcttgctaaaattct--------ttttagattattttaaatagtttaaatctcttatttatggat--------------------------tttaaggccttctgttaagtcgtctatccatataaatggagtgcattatcag-ggatcgacaaatttatatgtctgaaaggagaaatttcag----agcgatagaggccaaataaagaaaaaattggccat    
32 Mtau_G_16_X_F4     42.2%     ttggagcccattcgtccagtcg-tttatgagccatttttcagcttcctgttataataacttgatgttattt---taagcttctttaaggattagaggtt---------ttaatatcaattatatgattatttatcttgctaaaattct--------ttttagattattttaaatagtttaaatctcttatttatggat--------------------------tttaaggccttctgttaagtcgtctatccatataaatggagtgcattatcag-ggatcgacaaatttatatgtctgaaaggagaaatttcag----agcgatagaggccaaataaagaaaaaattggccat    
33 METH35_G_5_X_F4    41.7%     --------tcttttttcagaga-ttttaaacagatattactggatcgtttattaagggttcttcatgtattacataagtttaatctaata-------tt---------acaacaacttcaatttatttctattgatctttttgattcttatttctactgtagcatcatatttaattctcaaagtaaatttagggacatttaatattttgttttgttcaaaaaaattca------ttcaattaatcgttgatccatataaa-ataatctgtaaattgtggatggataattttaagtgtgatattggccaaaatataa----gctgtatcatgggaaataggcgaaatttcggccct    
   consensus/90%                ssssssTsssssssTssAsssu.ssTsTssssuuTTTsssAGGusssssTsuTsssAsssTsTssssTuTT...TuuuTsssTTsuAsTATssuussTT.........TTsusAssssssAsTsusTsusssssssssTsAuAssTCs........ssusssusssAssTusuTTsTssussTssssssssTusssAT......ssTTussssssssAsAuAAsTTsuuu......TusTAsussGTs......TATAssssuuusssGTTATsTussssTsGAsuss.TssuGTuTsuuAAAusssAAATsTsAu....uussAss.AsussusussusuuAsuATTsssCs..    

MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown