Reference sequence (1): Csac_A_G_2_X_F2
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70% and property
                             1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .     ] 246
 1 Csac_A_G_2_X_F2  100.0%     cagattttaagaatgtgagtttgctttaatctctggcagcagctggatagacggaaagggttgatagggttttattgcttgatttttcttagctgatattagttttccacagatgttttgatat-----------------------------aaaaacattgacaggtgtgcataaagttga-------------------------------tataataaaat----caagctcttcaacg---    
 2 Cobs_A_G_4_X_F2   76.7%     caagcctgcagtacgtagattagaccaaacttctggcatctgctggatagacggaagggttttatgggcttttatcccttggtttttctgggttgatttgagtttttcacagatgttttaatat-----------------------------aaaaacattgacaggggtgtataatcttga-------------------------------tataataaaat----caagttcttgaacgt--    
 3 Csac_A_G_6_X_F2   75.6%     caagaagatttgacatggtttttgcaaagtttctggcagcagctggatagacggaaggctttgaggtggctatatagcttgatttttctggcttgatgtgagttttccacagatgttttgatat-----------------------------aaaaacattgacaggggtgtataatcttga-------------------------------tataataaaat----caagctttttgacgt--    
 4 Clac_A_G_12_X_F2  70.6%     catgtttttgggatgtggctttgaataggtttctggcagcagttggatagacggaaggcttttaaaggcttcttccttttgatgcagctggatttgtgttgatttttaaggggtgtactaaaat-----------------------------aaaaacattgacaggggtgcataaagttga-------------------------------tataataaaat----caagctttttaacct--    
 5 Ckri_A_G_10_X_F2  75.0%     catatttatgggatgtgggtttgaacggattgctggcagcagatggatagacgaaaagggttgaaaggcttcttttgtttgatgcaactgggtttgt-ttgattttgaggggatgtatcaaaat-----------------------------aaaaacattgacaggggtgcataaagttga-------------------------------tataataaaat----caagcttttcaacct--    
 6 Cbes_A_G_6_X_F2   68.1%     aatgtatgcgggacatgggttttaatgaattgctggcagcagctggatagacggaaacctttgattaggctttaaaacttaatattgctggctttgagtttgtttttaaggtatgttctaaaat-----------------------------aaaaacattgacagtggtgcataatgttga-------------------------------tataataaaat----taaacctttcaatcaat    
 7 Cbes_A_G_8_X_F2   35.5%     aagagaattttagattttgtatttaccaattgctgtcgacctgcaatccccccaaaaacccccgggggtcgacagcaaaagacaaattttggcatgtattgacttgtgggcttttgaggtgtat-------------------------aatagaaataacatactgcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttatgagatttctcaaa-ttatctacgt--    
 8 Chyd1_A_G_6_X_F2  39.1%     tacatcttattgacttttgtatttaccaattgctgtcgacctgtaatccccccaaaaacccccggggatcgacagcaaaaggtaaattctggtatgtgttgactttcaagagcttgtggagtat-------------------------aatagaaataacctacagtagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgtaagatttctcaag-ccatctacgg--    
 9 Ckro_A_G_7_X_F2   36.7%     agacttaaattagcttttgtatttaccaattgctgtcgacctgcaatccccctaaaaacccccggggatcgacagcaaaaggtaatttctggtatgtgttgactttcaagagtttgtggagtat-------------------------aatagaaataacatactgcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgtggcatttttcaag-ccttctacg---    
10 Clac_A_G_3_X_F2   38.1%     ttgcatatatcaatttttgtatttaccaattgctgtcgacctgtaatccccccaaaaacccccgggggtcgacagcaaaaggtaatttctggcatgtgttgactttcaagagtttgtggggtat-------------------------aatagaaataacctacagcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgcggcttttcccaaa-ctatctacgg--    
11 Clac_A_G_4_X_F2   36.0%     ctgttacggctaattcttgcatttaccaattgctgtcgacctgtaatccccccaaaaacccccgggggtcgacagcaaaaggtaatttctgacatgtgttgactttcaagagtttgtggggtat-------------------------aatagaaataacctacagcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgcggcttttctcaaa-ctatctacgg--    
12 Chyd1_A_G_2_X_F2  39.8%     ctgcgaaataaagtttttgtatttaccaattgctgtcgacctgtaatccccccaaaaacccctgggggtcgacagcaaaaggtcgtttttggcatcccttgactttcaattgcttgtggaatat-------------------------aatagaaataatctacagtagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgtgaaatttctcaaa-ccatctacg---    
13 Cbes_A_G_3_X_F2   37.2%     ctatacttttttacttttgtatttaccaattgctgtcgacctgcaatttccccaaaaacccccggggatcgacagcaaaaggtaatttctggtatgtgttgattttcaagagcttgtggggtat-------------------------aatagaaacaatctatagttgcttgaaaacataa----------------------ccatttattccttgcgacgtttttcaaaaacctccacg---    
14 Ckro_A_G_6_X_F2   34.5%     aaataaattatgaattttgtattttccaattgctgtcgaactgcagtacccccaaaa--ccacgggggttgacagcaaaaggtaatttctggtatgtgttgactttcatgcttttgaggtgtat-------------------------aatagaaataacatactgcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgtcccttgtcgcatttttcaac-ctatccacgg--    
15 Cowe_A_G_2_X_F2   38.3%     ctgagatataaagcctttgcatttaccaattgttgtcgacctgcagaacccccgaaaacccccgggggtcgacagcaaaaggaatatattaccatgtgttgactttcaagagtttgtggagtat-------------------------aatagaaataacttatagcagcttgaaacttcat----------------------ccatttgttcctcataagactttacaag-ctctctacg---    
16 Cbes_A_G_9_X_F2   28.8%     ------------------gtttaaagtaatagacagcgatggcagattag----------taaatgcaacaacagcaagagatca--------------------tgaaaagatgttatattatgcacaagaagcgtttaatccaaattctagataaagaatgttcatgatttatagatttgataagaatggaaatttaaatttacttgatagttatgataaggttgcttcaaatgttttattt--    
   consensus/90%               ssssssssssssussssssssTsssssuuTsssTGsCuusssssuusssssCsuAAu..ssssususussssssssssssGussssssssussssss.TssusTTTssussssTssssssusAT.............................uAAAssAsssAssGssGsssusAAssTTuA...............................ssTsusuussT....sAAu.sssTssAss...    

MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown