Reference sequence (1): Csac_A_G_2_X_F2 Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . ] 246 1 Csac_A_G_2_X_F2 100.0% cagattttaagaatgtgagtttgctttaatctctggcagcagctggatagacggaaagggttgatagggttttattgcttgatttttcttagctgatattagttttccacagatgttttgatat-----------------------------aaaaacattgacaggtgtgcataaagttga-------------------------------tataataaaat----caagctcttcaacg--- 2 Cobs_A_G_4_X_F2 76.7% caagcctgcagtacgtagattagaccaaacttctggcatctgctggatagacggaagggttttatgggcttttatcccttggtttttctgggttgatttgagtttttcacagatgttttaatat-----------------------------aaaaacattgacaggggtgtataatcttga-------------------------------tataataaaat----caagttcttgaacgt-- 3 Csac_A_G_6_X_F2 75.6% caagaagatttgacatggtttttgcaaagtttctggcagcagctggatagacggaaggctttgaggtggctatatagcttgatttttctggcttgatgtgagttttccacagatgttttgatat-----------------------------aaaaacattgacaggggtgtataatcttga-------------------------------tataataaaat----caagctttttgacgt-- 4 Clac_A_G_12_X_F2 70.6% catgtttttgggatgtggctttgaataggtttctggcagcagttggatagacggaaggcttttaaaggcttcttccttttgatgcagctggatttgtgttgatttttaaggggtgtactaaaat-----------------------------aaaaacattgacaggggtgcataaagttga-------------------------------tataataaaat----caagctttttaacct-- 5 Ckri_A_G_10_X_F2 75.0% catatttatgggatgtgggtttgaacggattgctggcagcagatggatagacgaaaagggttgaaaggcttcttttgtttgatgcaactgggtttgt-ttgattttgaggggatgtatcaaaat-----------------------------aaaaacattgacaggggtgcataaagttga-------------------------------tataataaaat----caagcttttcaacct-- 6 Cbes_A_G_6_X_F2 68.1% aatgtatgcgggacatgggttttaatgaattgctggcagcagctggatagacggaaacctttgattaggctttaaaacttaatattgctggctttgagtttgtttttaaggtatgttctaaaat-----------------------------aaaaacattgacagtggtgcataatgttga-------------------------------tataataaaat----taaacctttcaatcaat 7 Cbes_A_G_8_X_F2 35.5% aagagaattttagattttgtatttaccaattgctgtcgacctgcaatccccccaaaaacccccgggggtcgacagcaaaagacaaattttggcatgtattgacttgtgggcttttgaggtgtat-------------------------aatagaaataacatactgcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttatgagatttctcaaa-ttatctacgt-- 8 Chyd1_A_G_6_X_F2 39.1% tacatcttattgacttttgtatttaccaattgctgtcgacctgtaatccccccaaaaacccccggggatcgacagcaaaaggtaaattctggtatgtgttgactttcaagagcttgtggagtat-------------------------aatagaaataacctacagtagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgtaagatttctcaag-ccatctacgg-- 9 Ckro_A_G_7_X_F2 36.7% agacttaaattagcttttgtatttaccaattgctgtcgacctgcaatccccctaaaaacccccggggatcgacagcaaaaggtaatttctggtatgtgttgactttcaagagtttgtggagtat-------------------------aatagaaataacatactgcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgtggcatttttcaag-ccttctacg--- 10 Clac_A_G_3_X_F2 38.1% ttgcatatatcaatttttgtatttaccaattgctgtcgacctgtaatccccccaaaaacccccgggggtcgacagcaaaaggtaatttctggcatgtgttgactttcaagagtttgtggggtat-------------------------aatagaaataacctacagcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgcggcttttcccaaa-ctatctacgg-- 11 Clac_A_G_4_X_F2 36.0% ctgttacggctaattcttgcatttaccaattgctgtcgacctgtaatccccccaaaaacccccgggggtcgacagcaaaaggtaatttctgacatgtgttgactttcaagagtttgtggggtat-------------------------aatagaaataacctacagcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgcggcttttctcaaa-ctatctacgg-- 12 Chyd1_A_G_2_X_F2 39.8% ctgcgaaataaagtttttgtatttaccaattgctgtcgacctgtaatccccccaaaaacccctgggggtcgacagcaaaaggtcgtttttggcatcccttgactttcaattgcttgtggaatat-------------------------aatagaaataatctacagtagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgttccttgtgaaatttctcaaa-ccatctacg--- 13 Cbes_A_G_3_X_F2 37.2% ctatacttttttacttttgtatttaccaattgctgtcgacctgcaatttccccaaaaacccccggggatcgacagcaaaaggtaatttctggtatgtgttgattttcaagagcttgtggggtat-------------------------aatagaaacaatctatagttgcttgaaaacataa----------------------ccatttattccttgcgacgtttttcaaaaacctccacg--- 14 Ckro_A_G_6_X_F2 34.5% aaataaattatgaattttgtattttccaattgctgtcgaactgcagtacccccaaaa--ccacgggggttgacagcaaaaggtaatttctggtatgtgttgactttcatgcttttgaggtgtat-------------------------aatagaaataacatactgcagcttgaaaacttaa----------------------ccatttgtcccttgtcgcatttttcaac-ctatccacgg-- 15 Cowe_A_G_2_X_F2 38.3% ctgagatataaagcctttgcatttaccaattgttgtcgacctgcagaacccccgaaaacccccgggggtcgacagcaaaaggaatatattaccatgtgttgactttcaagagtttgtggagtat-------------------------aatagaaataacttatagcagcttgaaacttcat----------------------ccatttgttcctcataagactttacaag-ctctctacg--- 16 Cbes_A_G_9_X_F2 28.8% ------------------gtttaaagtaatagacagcgatggcagattag----------taaatgcaacaacagcaagagatca--------------------tgaaaagatgttatattatgcacaagaagcgtttaatccaaattctagataaagaatgttcatgatttatagatttgataagaatggaaatttaaatttacttgatagttatgataaggttgcttcaaatgttttattt-- consensus/90% ssssssssssssussssssssTsssssuuTsssTGsCuusssssuusssssCsuAAu..ssssususussssssssssssGussssssssussssss.TssusTTTssussssTssssssusAT.............................uAAAssAsssAssGssGsssusAAssTTuA...............................ssTsusuussT....sAAu.sssTssAss... |
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