Reference sequence (1): Mjan_A_G_13_X_F4
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70% and property
                             1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         ] 440
 1 Mjan_A_G_13_X_F4 100.0%     agttcaaaggat-------------------------------ttttatttaatttctaagggttagctggtttgattgtttaaaatatttgagtttattgaattattcagattttt--aaaaattaggattaattaggtaagtaaataagat------ttctctaa---caga--caagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaatactaaaaggtttatattgtaagatggttatttatccttagaaa--aatatggtatagaa-----------------------aagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct---------------------------------------------------------------    
 2 Mjan_G_9_X_F4    100.0%     agttcaaaggat-------------------------------ttttatttaatttctaagggttagctggtttgattgtttaaaatatttgagtttattgaattattcagattttt--aaaaattaggattaattaggtaagtaaataagat------ttctctaa---caga--caagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaatactaaaaggtttatattgtaagatggttatttatccttagaaa--aatatggtatagaa-----------------------aagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct---------------------------------------------------------------    
 3 METH32_P_1_X_F4   71.8%     aatttagaggat-------------------------------ttttatttaatttctaaggatatggtagtttgattattcggaatatttaggtttattaaatcatttagattttt--aaaagttaaggttaaataataagctaaataaaat------ttctccaa---ccaa--taagttaaatcttcaaatttagaaatataaaaatcctctattttgtatataagaaaaaagcttatatagcgttggatttataaataaaagatgtcatctatacttagaaa--aatatggttccaaa-----------------------aagcttaaatataagaatgg-taattaaaactatattgtcgatgattgccct---------------------------------------------------------------    
 4 pMfs4_P_1_X_F4    71.8%     aatttagaggat-------------------------------ttttatttaatttctaaggatatggtagtttgattattcggaatatttaggtttattaaatcatttagattttt--aaaagttaaggttaaataataagctaaataaaat------ttctccaa---ccaa--taagttaaatcttcaaatttagaaatataaaaatcctctattttgtatataagaaaaaagcttatatagcgttggatttataaataaaagatgtcatctatacttagaaa--aatatggttccaaa-----------------------aagcttaaatataagaatgg-taattaaaactatattgtcgatgattgccct---------------------------------------------------------------    
 5 Mfs4_G_24_X_F4    72.7%     aatttagagaat-------------------------------ttaagttcaatttctaagggtctgtaagtttgattatttggaatatttatgtttattgaattatttagattttt--aaaagttaagagtgaatagtaagtaaaatgagat------ttctctaa---ctaa--taagttaaatcttcaaatttaaaagaataaaaatcctctattttgtatatgagaaaaaaacttatatagtgttggatttataaatgaaaggggttatttatacttagaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagaa-ctattaaaattatattatcgatgattgcctt---------------------------------------------------------------    
 6 METH32_G_24_X_F4  72.7%     aatttagagaat-------------------------------ttaagttcaatttctaagggtctgtaagtttgattatttggaatatttatgtttattgaattatttagattttt--aaaagttaagagtgaatagtaagtaaaatgagat------ttctctaa---ctaa--taagttaaatcttcaaatttaaaagaataaaaatcctctattttgtatatgagaaaaaaacttatatagtgttggatttataaatgaaaggggttatttatacttagaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagaa-ctattaaaattatattatcgatgattgcctt---------------------------------------------------------------    
 7 METH32_G_2_X_F4   74.4%     gatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtttgttgatttaattatttggaatgtttagatttattgaattatttagattttt--agaaattaagattggatatttagctaaatgggat------ttctctaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaagcttatatagcgttgggtttataaataaaggtagttatttgcccttagaaa--aatatacctccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct---------------------------------------------------------------    
 8 Mfs4_G_2_X_F4     74.4%     gatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtttgttgatttaattatttggaatgtttagatttattgaattatttagattttt--agaaattaagattggatatttagctaaatgggat------ttctctaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaagcttatatagcgttgggtttataaataaaggtagttatttgcccttagaaa--aatatacctccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct---------------------------------------------------------------    
 9 METH32_G_9_X_F4   77.9%     aatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtttgtaagtttgattatttggaatattcaggtttattgaattatttagattttt--aaaatttaaggttaaataattaggtaaataaaat------ttctctaa---ctaa--taagttaaatttttgaatttaggaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaaacttatatagtgttgggtttataaataaagatagttatttacccttagaaa--aatatacctccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct---------------------------------------------------------------    
10 Mfs4_G_9_X_F4     77.9%     aatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtttgtaagtttgattatttggaatattcaggtttattgaattatttagattttt--aaaatttaaggttaaataattaggtaaataaaat------ttctctaa---ctaa--taagttaaatttttgaatttaggaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaaacttatatagtgttgggtttataaataaagatagttatttacccttagaaa--aatatacctccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct---------------------------------------------------------------    
11 METH32_G_12_X_F4  72.7%     tatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtctgtaagtttgattattttaaatatttatgtctgttaaattatttagattttt--aaaatttgagattagatatttagctaaataaaat------ttctccaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatagaaaagcttatatagtgttggatttataaataaaggatgttatttacccttagaaa--aatacaccaccaaa-----------------------aattataaatattagaaaag-tgataaaaaatagattgtgaatgattgccct---------------------------------------------------------------    
12 Mfs4_G_12_X_F4    72.7%     tatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtctgtaagtttgattattttaaatatttatgtctgttaaattatttagattttt--aaaatttgagattagatatttagctaaataaaat------ttctccaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatagaaaagcttatatagtgttggatttataaataaaggatgttatttacccttagaaa--aatacaccaccaaa-----------------------aattataaatattagaaaag-tgataaaaaatagattgtgaatgattgccct---------------------------------------------------------------    
13 METH32_G_13_X_F4  73.7%     tatttagagggt-------------------------------ttttatttaatttctaagggtatagtgatttgattattttaaatatttatgttaattaaattattcagattttt--aaaatttaagattggataattggctaaataagaa------ttctctaa---ctaa--taagtcgaatcttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaagcttatatagcgttgggtttataaataaaggtagttatttgcccttagaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagaa-caataaaaaattaattgtgaatgattgccct---------------------------------------------------------------    
14 Mfs4_G_13_X_F4    73.7%     tatttagagggt-------------------------------ttttatttaatttctaagggtatagtgatttgattattttaaatatttatgttaattaaattattcagattttt--aaaatttaagattggataattggctaaataagaa------ttctctaa---ctaa--taagtcgaatcttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaagcttatatagcgttgggtttataaataaaggtagttatttgcccttagaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagaa-caataaaaaattaattgtgaatgattgccct---------------------------------------------------------------    
15 Mfs4_G_21_X_F4    75.0%     aatttagagggt-------------------------------ttttatttgatttctaagggtttgtaagtttgattatttggaatatttaggttcattaaattatttagattttt--aaaaattaagattgaatagtaagttaaatgggat------tcctctaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaaaataagaatactcaatttgattaa-aagggaaagatttaaatatcagaaggtttataaataaaaggtgtcatctatacttgaaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct---------------------------------------------------------------    
16 METH32_G_21_X_F4  75.0%     aatttagagggt-------------------------------ttttatttgatttctaagggtttgtaagtttgattatttggaatatttaggttcattaaattatttagattttt--aaaaattaagattgaatagtaagttaaatgggat------tcctctaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaaaataagaatactcaatttgattaa-aagggaaagatttaaatatcagaaggtttataaataaaaggtgtcatctatacttgaaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct---------------------------------------------------------------    
17 Mign_A_G_19_X_F4  53.9%     aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaaagatttgcatatttaaatttaaggatttattgagattttt--ggattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagggtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaacgtcccaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct---------------------------------------------------------------    
18 Mign_A_G_18_X_F4  53.9%     aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaaagatttgcatatttaaatttaaggatttattgagattttt--ggattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagggtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaacgtcccaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct---------------------------------------------------------------    
19 Mign_G_17_X_F4    53.9%     aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaaagatttgcatatttaaatttaaggatttattgagattttt--ggattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagggtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaacgtcccaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct---------------------------------------------------------------    
20 Mign_A_G_22_X_F4  54.9%     aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaataatccaaatctttaattttatggatttattgagattttt--tgattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagagtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaaggtttcgaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct---------------------------------------------------------------    
21 Mign_G_22_X_F4    54.9%     aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaataatccaaatctttaattttatggatttattgagattttt--tgattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagagtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaaggtttcgaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct---------------------------------------------------------------    
22 Mign_A_G_5_X_F4   53.9%     aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttatttttaagaatttaaatatttaattttatggatttattgagattttt--ggattttaaggaataataggaattatttcaagtt------ttccccga---ttga--tgaagtttatttaacgatttaaaacgattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagagaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaataccccttcgaaa--atcaatgctttaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct---------------------------------------------------------------    
23 Mign_A_G_26_X_F4  53.6%     aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaagaatttaaatctttaattttatggatttattgagattttt--tgatttaaaaacctaatagatcatatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagagtttatttaacgatttaaatcgattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaataccccttcgaaa--actaatgctttaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaaactttatataggaaaaagagcaaaatattgccct---------------------------------------------------------------    
24 Mign_A_G_9_X_F4   53.2%     aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcgaagggtgctttattttgaaagatttgcatatttaaatttaatgatttattgagattttt--ggatttaaaaacctaatagattatatttcaaatt------ttccccga---ttaa--tagggtttatttaacaatttaaaacgattttaaaaaattacttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacagtgttaataccccttcgaaa--attaacgtcccaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaaaagcaaaatatcgtcct---------------------------------------------------------------    
25 Mvul_A_G_5_X_F4   53.9%     ttttttatttgg-------------------------------ttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattgttttgtatatttggatgtgtttgattatggagtttttt--tgaagtttttagttatttgtagttgtttttagaa------atccacgg---ttga--ttaagtgtgttttatgtttttattttctgtttattgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtttataaaggaaaggggttatttaagggtagaaatttttatagtgtagaa-----------------------aaatataaatatcagtaaaaacattataatgaaataaggaaa--attaccct---------------------------------------------------------------    
26 Mvul_G_5_X_F4     53.9%     ttttttatttgg-------------------------------ttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattgttttgtatatttggatgtgtttgattatggagtttttt--tgaagtttttagttatttgtagttgtttttagaa------atccacgg---ttga--ttaagtgtgttttatgtttttattttctgtttattgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtttataaaggaaaggggttatttaagggtagaaatttttatagtgtagaa-----------------------aaatataaatatcagtaaaaacattataatgaaataaggaaa--attaccct---------------------------------------------------------------    
27 Mvul_A_G_15_X_F4  55.3%     ttttttatttgg-------------------------------ttttagttggtttctaagggttggtttgttttattgtttcttatatttggatgtttttgattatggagattttt--tagagtttttagttatttgtagttgtttttagaa------atccacgg---ttaa--ttaagtgtgttttttatttttattttatatttattgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtttataaagaaaaggggttatctatgggtagaaa-ttttatagtgtagaa-----------------------aaatataaatattagtaaaaacattataatgaaataagaaaa--attattct---------------------------------------------------------------    
28 Mvul_A_G_18_X_F4  53.4%     ttttttatttgt-------------------------------ttttagttggtttctgagggttggtttgtttaattgtttcttatatttagatgtgtttgattacagagattttt--tagtgtttttaatttattgcagttgtttttagaa------atccatgg---ttaa--ttaagtgtgttttttatttttattttctgtttattgttgttttttaaataaaagtttggattgttctgttgtagggtttataaagaaaaggggttatttatgggtagaaa-ttttatagtgtagaa-----------------------aactataaatattagtaaaaatattataacgaaataagaaaa--attaccct---------------------------------------------------------------    
29 Mvul_G_18_X_F4    53.4%     ttttttatttgt-------------------------------ttttagttggtttctgagggttggtttgtttaattgtttcttatatttagatgtgtttgattacagagattttt--tagtgtttttaatttattgcagttgtttttagaa------atccatgg---ttaa--ttaagtgtgttttttatttttattttctgtttattgttgttttttaaataaaagtttggattgttctgttgtagggtttataaagaaaaggggttatttatgggtagaaa-ttttatagtgtagaa-----------------------aactataaatattagtaaaaatattataacgaaataagaaaa--attaccct---------------------------------------------------------------    
30 Mign_A_G_10_X_F4  37.0%     tatttctaaaat---------------------------------cagaaagaaagttaaaaaattgtttgataagaaactgtataaaattagaggggtaatagaagcgatatttgg--agggctaaaaactaaatttagattaactctaaatgaaaaactacctgaaagtagatgtagagctactttagcagtagcaatcgttcataatatttta---------------acactaatgagagttattagtattagagagtaatatttaaattcattgatgaa----ataatttttcgaca-----------------------acctcaagcaaatagaaaactttatataggaaaaggagcaaaatattgtcct---------------------------------------------------------------    
31 Mign_A_G_17_X_F4  34.0%     aattctaaaaatgtgttttattattagagtagctatatattcattgtaacttatagctaaaggccttcctactttgcgtttttctttatatggaagta---------------------aaatatttataataaatgaaacaaaatcataagt------gtacttaatattgaa--tatcttaaacctcttatcgtaggctttccagtatccttttcttttggtttttctgccgctcataattattattactattatttat---------------------agtattcgtatttttcgaca-----------------------acctcaagcaaatagaaaactttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct---------------------------------------------------------------    
32 Mign_A_G_20_X_F4  28.7%     ------------------------------------------------------------------------------------tatggtaagcgttgtcgttaaaatcagacccttagggggatggaaatacattatattaacactttgcgc------ttgccaga----------------------------taaaattgttaaaatcagacccttagggggatggaaatgtttttaaagaaaaaaaagtttaaagtttaaag---------------gggaattaatattcgttaaaatcagcccttgggatggaaattttatttttacctaaaagaggcactgccgagcgtagcgaggcagtgcatcccttttgatgaaatcgaaccgtaaggttcgagctgcaaaaccgacaggttttgcttaacttttctaaa    
   consensus/90%               ssTTssusssus...............................TTssusssuuTTTCsuAGGussssssssTTTsAssusTssssATuTTTussTssusssusTsAsssAGATTTTT..suussTssssusssusTsssssssssssssuuss......sTCsssuu...ssuA..TsuussssuTsTsssusTTTsusssssTssssAssssssssTTsssssssuAsssssssssssssssusssssuGuTsTATAuAssAAsussGTsAssssssssTsuAAA..ssTAsssssssuAA.......................AAs..sAussAssAGsAuss.sssTssAusssAssssGssuA..ATTusCCT...............................................................    

MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown