Reference sequence (1): Mjan_A_G_13_X_F4 Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . ] 440 1 Mjan_A_G_13_X_F4 100.0% agttcaaaggat-------------------------------ttttatttaatttctaagggttagctggtttgattgtttaaaatatttgagtttattgaattattcagattttt--aaaaattaggattaattaggtaagtaaataagat------ttctctaa---caga--caagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaatactaaaaggtttatattgtaagatggttatttatccttagaaa--aatatggtatagaa-----------------------aagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--------------------------------------------------------------- 2 Mjan_G_9_X_F4 100.0% agttcaaaggat-------------------------------ttttatttaatttctaagggttagctggtttgattgtttaaaatatttgagtttattgaattattcagattttt--aaaaattaggattaattaggtaagtaaataagat------ttctctaa---caga--caagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaatactaaaaggtttatattgtaagatggttatttatccttagaaa--aatatggtatagaa-----------------------aagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct--------------------------------------------------------------- 3 METH32_P_1_X_F4 71.8% aatttagaggat-------------------------------ttttatttaatttctaaggatatggtagtttgattattcggaatatttaggtttattaaatcatttagattttt--aaaagttaaggttaaataataagctaaataaaat------ttctccaa---ccaa--taagttaaatcttcaaatttagaaatataaaaatcctctattttgtatataagaaaaaagcttatatagcgttggatttataaataaaagatgtcatctatacttagaaa--aatatggttccaaa-----------------------aagcttaaatataagaatgg-taattaaaactatattgtcgatgattgccct--------------------------------------------------------------- 4 pMfs4_P_1_X_F4 71.8% aatttagaggat-------------------------------ttttatttaatttctaaggatatggtagtttgattattcggaatatttaggtttattaaatcatttagattttt--aaaagttaaggttaaataataagctaaataaaat------ttctccaa---ccaa--taagttaaatcttcaaatttagaaatataaaaatcctctattttgtatataagaaaaaagcttatatagcgttggatttataaataaaagatgtcatctatacttagaaa--aatatggttccaaa-----------------------aagcttaaatataagaatgg-taattaaaactatattgtcgatgattgccct--------------------------------------------------------------- 5 Mfs4_G_24_X_F4 72.7% aatttagagaat-------------------------------ttaagttcaatttctaagggtctgtaagtttgattatttggaatatttatgtttattgaattatttagattttt--aaaagttaagagtgaatagtaagtaaaatgagat------ttctctaa---ctaa--taagttaaatcttcaaatttaaaagaataaaaatcctctattttgtatatgagaaaaaaacttatatagtgttggatttataaatgaaaggggttatttatacttagaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagaa-ctattaaaattatattatcgatgattgcctt--------------------------------------------------------------- 6 METH32_G_24_X_F4 72.7% aatttagagaat-------------------------------ttaagttcaatttctaagggtctgtaagtttgattatttggaatatttatgtttattgaattatttagattttt--aaaagttaagagtgaatagtaagtaaaatgagat------ttctctaa---ctaa--taagttaaatcttcaaatttaaaagaataaaaatcctctattttgtatatgagaaaaaaacttatatagtgttggatttataaatgaaaggggttatttatacttagaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagaa-ctattaaaattatattatcgatgattgcctt--------------------------------------------------------------- 7 METH32_G_2_X_F4 74.4% gatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtttgttgatttaattatttggaatgtttagatttattgaattatttagattttt--agaaattaagattggatatttagctaaatgggat------ttctctaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaagcttatatagcgttgggtttataaataaaggtagttatttgcccttagaaa--aatatacctccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct--------------------------------------------------------------- 8 Mfs4_G_2_X_F4 74.4% gatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtttgttgatttaattatttggaatgtttagatttattgaattatttagattttt--agaaattaagattggatatttagctaaatgggat------ttctctaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaagcttatatagcgttgggtttataaataaaggtagttatttgcccttagaaa--aatatacctccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct--------------------------------------------------------------- 9 METH32_G_9_X_F4 77.9% aatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtttgtaagtttgattatttggaatattcaggtttattgaattatttagattttt--aaaatttaaggttaaataattaggtaaataaaat------ttctctaa---ctaa--taagttaaatttttgaatttaggaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaaacttatatagtgttgggtttataaataaagatagttatttacccttagaaa--aatatacctccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct--------------------------------------------------------------- 10 Mfs4_G_9_X_F4 77.9% aatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtttgtaagtttgattatttggaatattcaggtttattgaattatttagattttt--aaaatttaaggttaaataattaggtaaataaaat------ttctctaa---ctaa--taagttaaatttttgaatttaggaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaaacttatatagtgttgggtttataaataaagatagttatttacccttagaaa--aatatacctccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct--------------------------------------------------------------- 11 METH32_G_12_X_F4 72.7% tatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtctgtaagtttgattattttaaatatttatgtctgttaaattatttagattttt--aaaatttgagattagatatttagctaaataaaat------ttctccaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatagaaaagcttatatagtgttggatttataaataaaggatgttatttacccttagaaa--aatacaccaccaaa-----------------------aattataaatattagaaaag-tgataaaaaatagattgtgaatgattgccct--------------------------------------------------------------- 12 Mfs4_G_12_X_F4 72.7% tatttagaggat-------------------------------ttaaatttaatttctaagggtctgtaagtttgattattttaaatatttatgtctgttaaattatttagattttt--aaaatttgagattagatatttagctaaataaaat------ttctccaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatagaaaagcttatatagtgttggatttataaataaaggatgttatttacccttagaaa--aatacaccaccaaa-----------------------aattataaatattagaaaag-tgataaaaaatagattgtgaatgattgccct--------------------------------------------------------------- 13 METH32_G_13_X_F4 73.7% tatttagagggt-------------------------------ttttatttaatttctaagggtatagtgatttgattattttaaatatttatgttaattaaattattcagattttt--aaaatttaagattggataattggctaaataagaa------ttctctaa---ctaa--taagtcgaatcttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaagcttatatagcgttgggtttataaataaaggtagttatttgcccttagaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagaa-caataaaaaattaattgtgaatgattgccct--------------------------------------------------------------- 14 Mfs4_G_13_X_F4 73.7% tatttagagggt-------------------------------ttttatttaatttctaagggtatagtgatttgattattttaaatatttatgttaattaaattattcagattttt--aaaatttaagattggataattggctaaataagaa------ttctctaa---ctaa--taagtcgaatcttcaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatggaaaagcttatatagcgttgggtttataaataaaggtagttatttgcccttagaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagaa-caataaaaaattaattgtgaatgattgccct--------------------------------------------------------------- 15 Mfs4_G_21_X_F4 75.0% aatttagagggt-------------------------------ttttatttgatttctaagggtttgtaagtttgattatttggaatatttaggttcattaaattatttagattttt--aaaaattaagattgaatagtaagttaaatgggat------tcctctaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaaaataagaatactcaatttgattaa-aagggaaagatttaaatatcagaaggtttataaataaaaggtgtcatctatacttgaaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct--------------------------------------------------------------- 16 METH32_G_21_X_F4 75.0% aatttagagggt-------------------------------ttttatttgatttctaagggtttgtaagtttgattatttggaatatttaggttcattaaattatttagattttt--aaaaattaagattgaatagtaagttaaatgggat------tcctctaa---ctaa--taagttaaattttcaaatttagaaaaataagaatactcaatttgattaa-aagggaaagatttaaatatcagaaggtttataaataaaaggtgtcatctatacttgaaaa--aatatggttccgaa-----------------------aagcttaaatattagaagag-tgattaaaattatattgtcgatgattgccct--------------------------------------------------------------- 17 Mign_A_G_19_X_F4 53.9% aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaaagatttgcatatttaaatttaaggatttattgagattttt--ggattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagggtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaacgtcccaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct--------------------------------------------------------------- 18 Mign_A_G_18_X_F4 53.9% aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaaagatttgcatatttaaatttaaggatttattgagattttt--ggattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagggtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaacgtcccaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct--------------------------------------------------------------- 19 Mign_G_17_X_F4 53.9% aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaaagatttgcatatttaaatttaaggatttattgagattttt--ggattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagggtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaacgtcccaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct--------------------------------------------------------------- 20 Mign_A_G_22_X_F4 54.9% aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaataatccaaatctttaattttatggatttattgagattttt--tgattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagagtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaaggtttcgaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct--------------------------------------------------------------- 21 Mign_G_22_X_F4 54.9% aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaataatccaaatctttaattttatggatttattgagattttt--tgattttaaggaataataggaattatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagagtttatttaacgatttaaatagattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaatacccctttgaaa--attaaggtttcgaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct--------------------------------------------------------------- 22 Mign_A_G_5_X_F4 53.9% aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttatttttaagaatttaaatatttaattttatggatttattgagattttt--ggattttaaggaataataggaattatttcaagtt------ttccccga---ttga--tgaagtttatttaacgatttaaaacgattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagagaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaataccccttcgaaa--atcaatgctttaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct--------------------------------------------------------------- 23 Mign_A_G_26_X_F4 53.6% aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcggagggtgctttattttgaagaatttaaatctttaattttatggatttattgagattttt--tgatttaaaaacctaatagatcatatttcaaatt------ttccccga---ttga--tagagtttatttaacgatttaaatcgattttaaaaaattatttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacactgttaataccccttcgaaa--actaatgctttaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaaactttatataggaaaaagagcaaaatattgccct--------------------------------------------------------------- 24 Mign_A_G_9_X_F4 53.2% aattttaaggat-------------------------------ttttatcaaatttcgaagggtgctttattttgaaagatttgcatatttaaatttaatgatttattgagattttt--ggatttaaaaacctaatagattatatttcaaatt------ttccccga---ttaa--tagggtttatttaacaatttaaaacgattttaaaaaattacttcgaatttaaacgatttttagggaagtgcagaggtatataaatgaacagtgttaataccccttcgaaa--attaacgtcccaaa-----------------------aag--aagcaaatagaaacctttatataggaaaaaaagcaaaatatcgtcct--------------------------------------------------------------- 25 Mvul_A_G_5_X_F4 53.9% ttttttatttgg-------------------------------ttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattgttttgtatatttggatgtgtttgattatggagtttttt--tgaagtttttagttatttgtagttgtttttagaa------atccacgg---ttga--ttaagtgtgttttatgtttttattttctgtttattgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtttataaaggaaaggggttatttaagggtagaaatttttatagtgtagaa-----------------------aaatataaatatcagtaaaaacattataatgaaataaggaaa--attaccct--------------------------------------------------------------- 26 Mvul_G_5_X_F4 53.9% ttttttatttgg-------------------------------ttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattgttttgtatatttggatgtgtttgattatggagtttttt--tgaagtttttagttatttgtagttgtttttagaa------atccacgg---ttga--ttaagtgtgttttatgtttttattttctgtttattgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtttataaaggaaaggggttatttaagggtagaaatttttatagtgtagaa-----------------------aaatataaatatcagtaaaaacattataatgaaataaggaaa--attaccct--------------------------------------------------------------- 27 Mvul_A_G_15_X_F4 55.3% ttttttatttgg-------------------------------ttttagttggtttctaagggttggtttgttttattgtttcttatatttggatgtttttgattatggagattttt--tagagtttttagttatttgtagttgtttttagaa------atccacgg---ttaa--ttaagtgtgttttttatttttattttatatttattgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtttataaagaaaaggggttatctatgggtagaaa-ttttatagtgtagaa-----------------------aaatataaatattagtaaaaacattataatgaaataagaaaa--attattct--------------------------------------------------------------- 28 Mvul_A_G_18_X_F4 53.4% ttttttatttgt-------------------------------ttttagttggtttctgagggttggtttgtttaattgtttcttatatttagatgtgtttgattacagagattttt--tagtgtttttaatttattgcagttgtttttagaa------atccatgg---ttaa--ttaagtgtgttttttatttttattttctgtttattgttgttttttaaataaaagtttggattgttctgttgtagggtttataaagaaaaggggttatttatgggtagaaa-ttttatagtgtagaa-----------------------aactataaatattagtaaaaatattataacgaaataagaaaa--attaccct--------------------------------------------------------------- 29 Mvul_G_18_X_F4 53.4% ttttttatttgt-------------------------------ttttagttggtttctgagggttggtttgtttaattgtttcttatatttagatgtgtttgattacagagattttt--tagtgtttttaatttattgcagttgtttttagaa------atccatgg---ttaa--ttaagtgtgttttttatttttattttctgtttattgttgttttttaaataaaagtttggattgttctgttgtagggtttataaagaaaaggggttatttatgggtagaaa-ttttatagtgtagaa-----------------------aactataaatattagtaaaaatattataacgaaataagaaaa--attaccct--------------------------------------------------------------- 30 Mign_A_G_10_X_F4 37.0% tatttctaaaat---------------------------------cagaaagaaagttaaaaaattgtttgataagaaactgtataaaattagaggggtaatagaagcgatatttgg--agggctaaaaactaaatttagattaactctaaatgaaaaactacctgaaagtagatgtagagctactttagcagtagcaatcgttcataatatttta---------------acactaatgagagttattagtattagagagtaatatttaaattcattgatgaa----ataatttttcgaca-----------------------acctcaagcaaatagaaaactttatataggaaaaggagcaaaatattgtcct--------------------------------------------------------------- 31 Mign_A_G_17_X_F4 34.0% aattctaaaaatgtgttttattattagagtagctatatattcattgtaacttatagctaaaggccttcctactttgcgtttttctttatatggaagta---------------------aaatatttataataaatgaaacaaaatcataagt------gtacttaatattgaa--tatcttaaacctcttatcgtaggctttccagtatccttttcttttggtttttctgccgctcataattattattactattatttat---------------------agtattcgtatttttcgaca-----------------------acctcaagcaaatagaaaactttatataggaaaaagagcaaaatattgtcct--------------------------------------------------------------- 32 Mign_A_G_20_X_F4 28.7% ------------------------------------------------------------------------------------tatggtaagcgttgtcgttaaaatcagacccttagggggatggaaatacattatattaacactttgcgc------ttgccaga----------------------------taaaattgttaaaatcagacccttagggggatggaaatgtttttaaagaaaaaaaagtttaaagtttaaag---------------gggaattaatattcgttaaaatcagcccttgggatggaaattttatttttacctaaaagaggcactgccgagcgtagcgaggcagtgcatcccttttgatgaaatcgaaccgtaaggttcgagctgcaaaaccgacaggttttgcttaacttttctaaa consensus/90% ssTTssusssus...............................TTssusssuuTTTCsuAGGussssssssTTTsAssusTssssATuTTTussTssusssusTsAsssAGATTTTT..suussTssssusssusTsssssssssssssuuss......sTCsssuu...ssuA..TsuussssuTsTsssusTTTsusssssTssssAssssssssTTsssssssuAsssssssssssssssusssssuGuTsTATAuAssAAsussGTsAssssssssTsuAAA..ssTAsssssssuAA.......................AAs..sAussAssAGsAuss.sssTssAusssAssssGssuA..ATTusCCT............................................................... |
MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown