Reference sequence (1): Hpyl_17C_G_2_X_X Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5] 501 1 Hpyl_17C_G_2_X_X 100.0% ctaagttttgagcgtctttaaggatagtggggttactgctttgagtgtagcttgtatcattgcttgcgatcgtgttatcgctagtcacaccccttaaagcgttttgggaatgagctacatcctcttgataggtttgttgggcttgttgttgtaaatcgtctcctaaaaattgggtaatgatggattgtttgtcaaaggtttcttgtaaggtttcatcttgcccgttaatgtcaaaggttacatcataagtgttgttacccacttcaacatggctaatggctttatcgcccttatagttgattagatcccacaaatagctttgataaaccccatactggatcgccccgtttgtagtgagaatgtcataggtttgattaccgctaagggtttgattgaggttaaagatcgcattagaattaaaagacacactgcctttaaggctagcaaaaggcgaacttgaatttaaagtgttagcgcctgagaaactcaccttgct--gct 2 Hpyl_J_G_2_X_X 100.0% ctaagttttgagcgtctttaaggatagtggggttactgctttgagtgtagcttgtatcattgcttgcgatcgtgttatcgctagtcacaccccttaaagcgttttgggaatgagctacatcctcttgataggtttgttgggcttgttgttgtaaatcgtctcctaaaaattgggtaatgatggattgtttgtcaaaggtttcttgtaaggtttcatcttgcccgttaatgtcaaaggttacatcataagtgttgttacccacttcaacatggctaatggctttatcgcccttatagttgattagatcccacaaatagctttgataaaccccatactggatcgccccgtttgtagtgagaatgtcataggtttgattaccgctaagggtttgattgaggttaaagatcgcattagaattaaaagacacactgcctttaaggctagcaaaaggcgaacttgaatttaaagtgttagcgcctgagaaactcaccttgct--gct 3 Hpyl_X_G_1_X_X 84.0% ctaaactttgagcgtcttttttgatagtggtgttttgattgttggtgtagcctgtatcagcgcttgcgatcttattatcactagtagcgttatttaaagcggtttgtgaattgctcaagtcttgttggtaggttgctttagctttggcttgtaaatcgtcccctaaaaattgggtggtaatggactgattgttaaaggtttcttgtaaggtttcatcttgcccgttaatgtcaaaggttacatcataagtgttactacccacttcaacatggcttatagctttatcgcccttatagttgatcaaatcccacaaatagctttgataaaccccatattggatagtcccgtttgtggtgagaatgtcataggtttgattggcattaagggtttgattgaggttaaagatcgcgccagaaccaaaggatacactgcctttaaggctagcaaaaggcgaacttgaatttaaagtgttagcgcctgaaaaactcaccttgcttgcat 4 Hpyl_169Sh_G_2_X_X 84.4% ctaaactttgagcgtcttttttaatagtggtgttttgattgttggtgtagtctgtatcactgcttgcgatcttattatcactagtagcgttctttaaagcggtttgggagttactcaagtcttgttggtaggttgcttgagctttggcttgtaaatcgtcccctaaaaattgggtggtaatggactgattgttaaaggtttcttgtaaggtttcatcttgcccgttaatgtcaaaggttacatcataagtgttactacccacttcaacatggctaatagctttatcgcccttatagttgatcaaatcccacaaatagctttgataaaccccatattggatggtctcatttgtggtgagaatgtcataggtttgattggcattaagggtttgattgaggttaaaaatcgcaccagaaccaaaagacacactgcctttaaggttagcaaaaggcgaacttgaatttaaagtgttagcgcctgaaaaactcaccttgcttgtat consensus/90% CTAAusTTTGAGCGTCTTTsssuATAGTGGsGTTsssusTsTsuGTGTAGssTGTATCAssGCTTGCGATCsTuTTATCuCTAGTsuCussssTTAAAGCGsTTTGsGAuTsusssAsuTCsTsTTGuTAGGTTssTTsuGCTTssssTTGTAAATCGTCsCCTAAAAATTGGGTuuTuATGGAsTGsTTGTsAAAGGTTTCTTGTAAGGTTTCATCTTGCCCGTTAATGTCAAAGGTTACATCATAAGTGTTusTACCCACTTCAACATGGCTsATuGCTTTATCGCCCTTATAGTTGATsAuATCCCACAAATAGCTTTGATAAACCCCATAsTGGATsGsCsCuTTTGTuGTGAGAATGTCATAGGTTTGATTusCusTAAGGGTTTGATTGAGGTTAAAuATCGCussAGAAssAAAuGAsACACTGCCTTTAAGGsTAGCAAAAGGCGAACTTGAATTTAAAGTGTTAGCGCCTGAuAAACTCACCTTGCT..ssT |
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