Reference sequence (1): Ahae1_A_G_3_M1_F1 Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . ] 378 1 Ahae1_A_G_3_M1_F1 100.0% gcagtacgg-----------aaaggaagatgatgtttgcagtagtaactttgactgcggctcctgatcatttacacgggtatttgaacagattcctcacagaagtagatagtggtatttatgtaggaaatatttctcgagccgtttgtgaaaaattgtgggaaagaatcggagaagttccttttaacggaaatgcaaatataatttatagcgacaacacgagagaacaggggttttcagtgaaaactaaaggacgcaccgcgtgcgacattgttgatctagatggagctatccttatctccaatcgtgttgcgcgcggtgaacaaaaac-tccgttacaa-----------ccgctgaaaaagcgcaggtcagttagt 2 Cglu_B_G_4_M1_F1 55.3% ccaatacggcagctaaatttaaggtagaaatatgtttctcgtcatcgtgtctcgatcattaccagaccacctgagtggttacttgagtagatttctgtcagaagtagataccggggtttttgttggcaacgtatcaagaagagttagagataacttgtggaaacgttgcggacaagcccttaaatccggaagtttgacaatgataaataatgatccgtcccgagaacaggggtttgctgttaacacaatggggccacgaagacgtaatatcattgatatggatgg-gcttttattggtttctaccttatcgtctgcgatcgccaaaaacgaccgcaacga-----------ttcctaaaaga--ccagttcagggagt 3 Cdip_A_G_4_M1_F1 54.7% acagtatggcaagg------agattaactagatgttcgctgtactttaccttcaggcagcacctgatcatctccttggttacgtcacccgtttccttactgaagcggatacaagcatctatgttggaaatgtttccaaaaacgtagcttcaaacttatggattcgtgtaacagaagctattaaagatgctcatgccacaatgattgtgagcgataattctcgtgagcaaggtttctcaataatgacgacaggtgatagcacactacaagttcttgatgcagatgg-gttatccgt--------cctggcttcacgccctggacga-----gccgctgtaaaattacatggcctacagtaaaactgcagtacagttagt consensus/90% sCAuTAsGG...........AuussAussssATGTTssssGTssTsssssssssssCusssCCsGAsCAssTssssGGsTAssTsAsssGsTTsCTssCsGAAGsuGATAssuGsuTsTsTGTsGGsAAsuTsTCssuAussGTsssssssAAsTTuTGGusssGssssusAsAAGssssTssssssGsssuTsssAssATuATssssAusGAsssssCssGsGAuCAuGGsTTssCsuTsAssACsAsuGGsssssssusussssAsuTssTTGATssuGATGG.GsTsTsssT........sCssussssssGCssTsusCuA.....sCCGssusuA...........sssCsusAAuA..sCAGssCAGssAGT |
MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown