Reference sequence (1): Cthe5_A_G_4_M9_F10 Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . ] 443 1 Cthe5_A_G_4_M9_F10 100.0% ttttcctgctattttctgtcttattatgcttttggattgaaacaacgacttctgttaaa------------tttggaaattaaactctacttttcttaaatgaaatat--aataaaaaagcttaatttataaaactttaaagaatgctgtcaacgaaatggaattccaaattgtaatatttgttgaaaagattattagtttatgatatatataagttgtaa-gttggattgtgagtggaaaaatgtggctgcaaaattattggaaaatttgaagtgatgggcttgtaaatcttgaaaatggcgggtttgaagcctatgttggtgactgaaaaatgggtggaatttgataaaaatcgactattttttgatgaaaaatgtgcaaaaaagtttcgtcaaaaaaatcttgtaggctttgaaaatggcgggatttgacttcgaggact 2 Ccla_A_G_5_M9_F10 55.0% aaatagagttctttttgataaaagcagaagtggacagggcaac-----------taaagtgttgacggagtatagggatataaagcctgtatttgtaaatgcaattaaggagcagaacaggatattggaggaaagccttgaaaaaatcaggagatttatggaggaatagg--aacagagaagttgaatatatagttaaattgtgatatgttaaaaatgaaa--gagatgggtatatggaaatatgtggatgcaaaattattgggaaatttgaagtcacaggcttgtaagtattgaaatttgggggttataagcttgtgttgatgattaaaaaatgtgattttttatatgaaaaaattgtgttttgcaataaaattagctcaaaaaaagtccgtcaaaaaaagcttgtaaggcttgaggtatgaaggattaagcttcgcggact 3 Cthe_B_G_1_M9_F10 55.1% tatttttgctcatggttatgaatttattagtaaagaaaagtataatgaatttaaaaaagtggttgaagattatatgaacttgttgtgttctatagaaggaatagataa--agaagaactgtttgattcatgcgagtttataaagctatagccgagagttaatatgattaa-agaataaggtgttgaaattaaaaccagattatgttatgttttaattaaagtgataagtaacattttacaaaatgtggatacaaaattattgagaattttgagttcatgttcgttaaagccttggaaatagtggtatggaagcttatgttgatagcaaaaaattgaatgaaaaatggtggattttaggagaattttgataaaatatgaccaaaaaagttcagtcaaaaaaatcttgtaagcattgacatttaagcaatatcacctcgaggact consensus/90% sssTsssGsTssTssssuTssssssAssssTssusAssussAs...........ssAAu............sTssGuAssTusssssTssssTssssuusssAusTAs..AusAuAAssGssTusTssAsusuAsssTssAuAussssusssusssssTuususssssuu..ussssAsssGTTGAAsssAssussAusTTuTGsTATuTsssAusTusAu..ssuusssusussTsusAAsATGTGGsTuCAAAATTATTGuuAAsTTTGAusTsAsussCsTssAAussTTGuAAsTsGsGGssTssAAGCsTuTGTTGuTuussuAAAAsTGsusssssssssuTuuAssssssssussTTssuATuAAAsssGssCAAAAAAusTssGTCAAAAAAAsCTTGTAuGssTTGAsusssususuATsssuCsTCGsGGACT |
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