Reference sequence (1): Saci6_C_G_3_X_F3 Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . ] 240 1 Saci6_C_G_3_X_F3 100.0% cgtcataaggtttataaacgtcatttttcgagtctcaatgcaacctatcccaacttagtcacaaccccttaacatttataaatgcacaaccatctttcaactctagttaagcactatgcgaccaaaagacctaaacataattactaggattcaaggtcgcat-gattaagttaggggcttaagcaaaagtttattaacaagaacgtcaaatttaggataagg-gaataataaatacatca 2 Saci6_B_G_3_X_F3 100.0% cgtcataaggtttataaacgtcatttttcgagtctcaatgcaacctatcccaacttagtcacaaccccttaacatttataaatgcacaaccatctttcaactctagttaagcactatgcgaccaaaagacctaaacataattactaggattcaaggtcgcat-gattaagttaggggcttaagcaaaagtttattaacaagaacgtcaaatttaggataagg-gaataataaatacatca 3 Saci6_A_G_3_X_F3 100.0% cgtcataaggtttataaacgtcatttttcgagtctcaatgcaacctatcccaacttagtcacaaccccttaacatttataaatgcacaaccatctttcaactctagttaagcactatgcgaccaaaagacctaaacataattactaggattcaaggtcgcat-gattaagttaggggcttaagcaaaagtttattaacaagaacgtcaaatttaggataagg-gaataataaatacatca 4 Saci6_C_G_4_X_F3 76.2% tttcatgaagtttataaatgttgtttttcgagtctcaatgcgacccatcccaacttagttacaacccctcaacatttataaatacacaaccatctttcaactctagttaagcaccatgcgaccaaaaaacctaaacacaattactaggacttaaggtcgcattaaagttccccataaaacacctaaaatttaaatacaaggaaagggaaaaataagacaagg-gatataaaaacaaacca 5 Saci6_B_G_4_X_F3 76.2% tttcatgaagtttataaatgttgtttttcgagtctcaatgcgacccatcccaacttagttacaacccctcaacatttataaatacacaaccatctttcaactctagttaagcaccatgcgaccaaaaaacctaaacacaattactaggacttaaggtcgcattaaagttccccataaaacacctaaaatttaaatacaaggaaagggaaaaataagacaagg-gatataaaaacaaacca 6 Saci6_A_G_4_X_F3 76.2% tttcatgaagtttataaatgttgtttttcgagtctcaatgcgacccatcccaacttagttacaacccctcaacatttataaatacacaaccatctttcaactctagttaagcaccatgcgaccaaaaaacctaaacacaattactaggacttaaggtcgcattaaagttccccataaaacacctaaaatttaaatacaaggaaagggaaaaataagacaagg-gatataaaaacaaacca 7 Ahos_A_G_2_X_F3 57.1% ccatttatagtttaaaaacgataaagttttagtctcaatgcgaccattgcgagaatcaaaagaagaattgaagccttataaataat-ttctctctttcaattagtgaaaaagaccatgcgaccgtattacgaattcttaattacaacgaaaaccggtcgcat-gatgaactaagagaagtgatgaaaacttattaatgagaaaagagagaaataaggacaga-gattaataaaacaaaca 8 Ahos_A_G_4_X_F3 58.8% tcatttatagtttaaaaacgataaagttttagtctcaatgcgaccgttgcgagaatcaaaagaagaattgaagccttataaataat-ttctctctttcaattagtgaaaaagaccatgcgaccgtattacgaattcttaattactaggaaaattggtcgcat-gatgaaatcagaggtgtaatgaaaacttattaatgaggaaagagaaaaataaggacaga-ggttaataaaacaaaca 9 Ahos_G_4_X_F3 58.8% tcatttatagtttaaaaacgataaagttttagtctcaatgcgaccgttgcgagaatcaaaagaagaattgaagccttataaataat-ttctctctttcaattagtgaaaaagaccatgcgaccgtattacgaattcttaattactaggaaaattggtcgcat-gatgaaatcagaggtgtaatgaaaacttattaatgaggaaagagaaaaataaggacaga-ggttaataaaacaaaca 10 Ahos_G_1_X_F3 58.4% ccatttatagtttaaaaacgataaagttttagtctcaatgcgaccgttgcgagaatcaaaagaagaattgaagccttataaataat-ttctctctttcaattagtgaaaaagaccatgcgaccgtattacgaattcttaattactaggaaaattggtcgcat-gatgaactaagagaagtgatgaaaacttattaatgaggaaagagaaaaataaggacaga-ggttaataaaacaaaca 11 Ahos_A_G_1_X_F3 58.4% ccatttatagtttaaaaacgataaagttttagtctcaatgcgaccgttgcgagaatcaaaagaagaattgaagccttataaataat-ttctctctttcaattagtgaaaaagaccatgcgaccgtattacgaattcttaattactaggaaaattggtcgcat-gatgaactaagagaagtgatgaaaacttattaatgaggaaagagaaaaataaggacaga-ggttaataaaacaaaca 12 Ssol98_G_7_X_F3 55.0% catgaagttgtttaaaagtgtgaaagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttctataataattgaacgtttataaatgatagggtgtatttcaatttaacataaaatccttgcgaccagaaattgttaaattaattacaactaaaattggtcgcat-gaagagtaaagggtagtcatgaagatttataagtaagaaaagag-aaagaaagatagga-agtataaaaacacaaca 13 Ssol_A_G_3_X_F3 55.0% catgaagttgtttaaaagtgtgaaagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttctataataattgaacgtttataaatgatagggtgtatttcaatttaacataaaatccttgcgaccagaaattgttaaattaattacaactaaaattggtcgcat-gaagagtaaagggtagtcatgaagatttataagtaagaaaagag-aaagaaagatagga-agtataaaaacacaaca 14 Ssol_B_G_7_X_F3 55.0% catgaagttgtttaaaagtgtgaaagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttctataataattgaacgtttataaatgatagggtgtatttcaatttaacataaaatccttgcgaccagaaattgttaaattaattacaactaaaattggtcgcat-gaagagtaaagggtagtcatgaagatttataagtaagaaaagag-aaagaaagatagga-agtataaaaacacaaca 15 SsolP2_G_3_X_F3 55.0% catgaagttgtttaaaagtgtgaaagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttctataataattgaacgtttataaatgatagggtgtatttcaatttaacataaaatccttgcgaccagaaattgttaaattaattacaactaaaattggtcgcat-gaagagtaaagggtagtcatgaagatttataagtaagaaaagag-aaagaaagatagga-agtataaaaacacaaca 16 Ssol_A_G_4_X_F3 55.5% tatgaagttgtttaaaagtgtgaaagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttctataataattgaacgtttataaatgatacccaatgtttcaatttaacataaaatccttgcgaccagaaattgttaaattaattacaactaaaattggtcgcat-gaagagtaaagggtagtcatgaagatttataagtaagaaaggagaaaagaaaaatagga-agtataaaaacacaaca 17 Ssol_B_G_8_X_F3 55.5% tatgaagttgtttaaaagtgtgaaagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttctataataattgaacgtttataaatgatacccaatgtttcaatttaacataaaatccttgcgaccagaaattgttaaattaattacaactaaaattggtcgcat-gaagagtaaagggtagtcatgaagatttataagtaagaaaggagaaaagaaaaatagga-agtataaaaacacaaca 18 SislM1627_G_1_X_F3 54.6% tatgaagtggtttaaaagtgtcggagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttttcgtataattgaacgtttataaataatggggtatatttcaattgaatggtaaatccttgcgaccaaaaattgttaaattaattacaactagaatcggtcacat-gaggagtaaaggataataatgaagatttataagcaagaaaggagtaaagtaagataaga-agtataaaaacacaaca 19 Sisl_F_G_1_X_F3 54.6% tatgaagtggtttaaaagtgtcggagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttttcgtataattgaacgtttataaataatggggtatatttcaattgaatggtaaatccttgcgaccaaaaattgttaaattaattacaactagaatcggtcacat-gaggagtaaaggataataatgaagatttataagcaagaaaggagtaaagtaagataaga-agtataaaaacacaaca 20 SislM14_G_1_X_F3 54.6% tatgaagtggtttaaaagtgtcggagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttttcgtataattgaacgtttataaataatggggtatatttcaattgaatggtaaatccttgcgaccaaaaattgttaaattaattacaactagaatcggtcacat-gaggagtaaaggataataatgaagatttataagcaagaaaggagtaaagtaagataaga-agtataaaaacacaaca 21 Sisl_B_G_1_X_F3 54.6% tatgaagtggtttaaaagtgtcggagttcgagtctcaatgcgaccgaaacgaatctttttcgtataattgaacgtttataaataatggggtatatttcaattgaatggtaaatccttgcgaccaaaaattgttaaattaattacaactagaatcggtcacat-gaggagtaaaggataataatgaagatttataagcaagaaaggagtaaagtaagataaga-agtataaaaacacaaca 22 Stok_A_G_1_X_F3 54.8% ctatgtgaggtttaaaaacgtaaatttagtaaaactggtgcgactaatacgatgatagtaccgaatgattaacatttataaacaac-acttttaattcaactctagagttgaacaatgcgaccaaaaaagggaaaagaaaatactaggaaaaacggtcgcaa-gaagaaaaaaccttaaaaacaaaaacttataaaggagaaaaacgaaaaatgaagtaaaataatataaaaacaaaacg 23 Stok_A_G_2_X_F3 54.0% ttacaagagatttaaaaacgtaaatttagtaaaactggtgcgactaatacgatgatagtaccgagtgattaacatttataaacaac-acttttaattcaattctagagttgaacaatgcgaccaaaaaagggaaaagaaattactaggaaaaatggtcgcaa-gaag-aaaaaccttaaaaacaaaaacttataaaggagaaaaacgaaaaatgaagtaaaataatataaaaacaaaacg 24 Stok_G_2_X_F3 54.0% ttacaagagatttaaaaacgtaaatttagtaaaactggtgcgactaatacgatgatagtaccgagtgattaacatttataaacaac-acttttaattcaattctagagttgaacaatgcgaccaaaaaagggaaaagaaattactaggaaaaatggtcgcaa-gaag-aaaaaccttaaaaacaaaaacttataaaggagaaaaacgaaaaatgaagtaaaataatataaaaacaaaacg consensus/90% ssssssussGTTTAsAAusGssusssTsssAussssuuTGCuACsssssCsAsssTsssssssAssssTsAAsssTTATAAAsuss.sssssTssTTCAAsTssssssssussCssTGCGACCusAssssssssssssAATTACsAssAsssssGGTCuCAs.uAsssssssssssssssssssAAuAsTTssssussAuuAAsuss.AAsssuuuussuuu.uusssAsAAAsssAsCu |
MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown