Reference sequence (1): Cbot_K_G_9_M6_F7
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70% and property
                               1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .     ] 276
 1 Cbot_K_G_9_M6_F7   100.0%     ------aatgagcagagatatattttatatttaactaatttttttcacgtgaattcaatttta-aaatctattctagctat--------------------tgaaa------tgtaagtc-ttagaataggtttttattatgtatttatgaa---------aaaacaaaatcacttggaaaaatctctatagaatattgtaaaattaatggttatatgat-----attcttaaaaataagaaatggtcattttactat------------------    
 2 Cbot_A_G_7_M6_F7    80.0%     ------tttattaatgaacatagtgtatatataattaaatttttccaagtgaatttaatcttc-aaacctatcctacccat--------------------tgaaa------tataagga-ttaggataggtttttattgtgtatttatgaa---------aaaacaaaatcacttggaaaaatttctacaaaaccttgtaaaatcaatggatatatgat-----attcttgtaaataaagaatggctattttactat------------------    
 3 Cbot_N_G_6_M6_F7    77.7%     ------------gttatgtactacttgtgtatatttaaagttttccaagtgaactcaaattca-aaacctattctaagcat--------------------tgata------tataagga-ttagaataggtttttattatgtgtttttgaa---------aaatcaaaatcacatggaaaaatttatataaaaccttgtaaaatcaatgtttatatgat-----attcttagaaataaggaatggctattttactatgc----------------    
 4 Cbot_L_G_11_M6_F7   71.9%     -------tctataagtatatgagtgtttgttaggttatattttcccaagcgaattcacattta-aagcttattctaagcat--------------------tgata------tataagca-ttagagtatgttttcattatgaatttttaaa---------aaagtagaatcacttggaaaaatttctgtgaaatcttgtaaaatcaatgggtatatgat-----atttttagaaataaggaatggctattttactatg-----------------    
 5 Cbot_M_G_1_M6_F7    72.9%     -------ttcattattaagcatagtatatataattaagttttttccaagtgaattaaagataa-aaacctactctagttat--------------------tgaaa------cataaggc-ttaggataggtttttattatgagttttcaaa---------aaagcaaaattacctggaaaaacttctacaaaaccttgtaaaatcaatggggatatgat-----attcttaaaaataaggaatggctattttactatg-----------------    
 6 Cbot_K_G_12_X_F7    75.7%     -------agtatatagcagttaaaaattatttctaaatatttttccaagtgaattaaaagtct-aaacctattctagccat--------------------tgaaa------tataaggc-ctaggataggtttttattatgaaatttt-aa---------aaaacaaaatcacttggaaaaatttctataaaaccttgtaaaatcaatggttgtatgat-----attcttaaaaataaggaatggctattttactatggtta-------------    
 7 Cbot_L_G_5_M6_F7    74.0%     --------ggaagcaacgagaaggagttttataaattgaattttccaggcgtaataaatttta-aaacttattctagctat--------------------tgaaa------tataaggc-ttagaataggttcttgttatgtctttataaa---------aaatgggaattagttggaaaattttctataaaaccttgtaaaatcagtgggtgtatgat-----attcttaaaaataaggaatggctattttactat------------------    
 8 Cbot_N_G_4_M6_F7    76.7%     -------ggagagtaggataaagagtttcataaattgaatttttccacgcgtaacaaatttta-aaacctattctagctat--------------------tggta------tataaggc-ttaggataggtttgctttatgtatttattaa---------aaaacgtaatcacttggaaaactttctatagaaccttgtaaaatcaatggctatatgct-----attcttaaaaataaggaatggctattttactatg-----------------    
 9 Cbot_K_G_14_M6_F7   76.2%     -------agtacaaataaaatatttttatattaattgaatttttccaagcacaataaatttat-aaacctattctagtcat--------------------tgata------tataagga-ttggaataggttcttattttgtatttataaa---------aaaacaaaatcacttggaaaactttctacgaaaccttgtaaaatcaatgggtttatgct-----attcttaaaaataaggaatggctattttactatg-----------------    
10 Cbot_K_G_13_M6_F7   71.7%     ------gcgcaatccaaatatattgtaaagttaactgaattttcccagccaaaataaatttta-aaacctatttagagcgt--------------------tgaca------cataaggc-ttatggtaagtttttattttatatttgt-aa---------aaagcaaaactacttggaaaaatttctttaaaatcttgtaaaatcaatggttgtatgat-----atccttgaaattaaagaatggctattttactatgg----------------    
11 Cbot_L_G_13_M6_F7   72.0%     ------gcgcaatccaaatatattgtaaagttaactgaattttcccagccaaaataaatttta-aaacctatttagagcgt--------------------tgaca------cataaggc-ttatggtaagtttttattttatatttgt-aa---------aaagcaaaactacttggaaaaatttctttaaaatcttgtaaaatcaatggttgtatgat-----atccttgaaattaaagaatggctattttactatg-----------------    
12 Cbot_C_G_11_M6_F7   73.0%     ------ccgcaatacaaatatattgtaaagttaactgaatttttccaaccaaaataaatttta-aaacctatttagagcgt--------------------tgaca------cataaggc-ttatggtaagtttttattttatatttgt-aa---------aaagcaaaactacttggaaaaatttctttaaaatcttgtaaaatcaatggttgtatgat-----atccttgaaattaaagaatggctattttactatg-----------------    
13 Cbot_J_G_6_M6_F7    72.5%     -------tgaggaagcgagaaggagttctactaactgaatttttccagccaaaataaatttta-aaacctattttgagcgt--------------------tgaca------tataaggc-ttatggtaggtttttattttatatttgtaaa---------aaagcaaaactacttggaaaactttctttaaaatcttgtgaaattaatggttgtatgat-----attcttaaaaataaggaatggctattttactatgg----------------    
14 Cbot_K_G_2_M6_F7    67.6%     -------gctatgaataaaaacaaaaaaaattctaaaagtttttccaaccgcatttaattcta-aagcctatcctaagcat--------------------tgcaa------tataaggc-ttaagataggttttatttatgtttttctgaa---------aaatcataaatggttggaaaaatttttttcaaccattgtaaaatcaaatgctatatgct-----attcttaaaattaaggaatggctaatttactata-----------------    
15 Cbot_J_G_1_M6_F7    69.5%     -------agtaactaattaatctaattataagtaaaagaattttccaaccacatttaatttta-aattctattctaggtat--------------------tgaaa------tataagcc-ttaagataagctttatctatgtctttataaa---------aaatgacaaacggttggaaaaatttctttgaaaccttgtaaaattaaaggctatatgct-----attcttagaattgagaaatggctattttactatg-----------------    
16 Cbot_K_G_1_M6_F7    67.5%     -------agtaactaattaatctaattataagtaaaagaattttcaaaccgcatttaatttta-aaatatattctaggcat--------------------tgaaa------tataagcc-ttaagataagctttatctctatctttataaa---------aaatggcaaacggttggaaaaaattctttaaaatcttgtaaaatcaaggcttctatgat-----attcttagaattaagaaatggctattttactatggt---------------    
17 Cbot_N_G_1_X_F7     68.1%     -------ttttactaattaatctagctatgaggaaaatatctttccaaccacatttaatttta-aaatccatcttagacat--------------------tgaaa------tatagggc-ttaagataggcttttattatgattttataaa---------aaatagaaattgattggaaaaatttctttaaaatcttgtaaaatcaatacttatatgat-----aatcttgaaattaaggaatggctattttcctata-----------------    
18 Cbot_I_G_7_M6_F7    64.9%     -------agaggtattttccttcatggaaataccttttatttttccaacctactttaatttta-aaacctatcttagtcat--------------------tgcta------tacaatgctttagggtaggttttctatataaattt-taaa---------ttatctcaattggttggaaaattttctttagaatcttgtaaaatcaatacttctatgtt-----atccttaaaaataaggaatggctattttactatg-----------------    
19 Cklu_A_G_6_M6_F7    54.5%     ------attttatatttatttttaaaatccccgttagtatttttccaaccttagacaagtaaa-aatcttatataaactgt--------------------tgata------tacaatgc-ttccaaggcgattttattcttataaatacag---------aaaataaaattgcctggaaaaatttttataaaatcctttattttcaatacttaaagaga-----tataatgaaaataagaaatggctattttacatta-----------------    
20 Caut_D_G_3_M6_F7    55.7%     -------tttatacaatatattactacattttgttgagtattttccaactaatttggaggata-gagatgtcttaagtcat--------------------ttgaa------ttcaatgg-atgagggtactttttttattgagtttgtgaa---------aagtgaaaaacggttggaaaattttctgttgatgcctttattattaagggttttaggac-----tataatgaaaataagaaatggctattttactgtg-----------------    
21 Caut_D_G_2_M6_F7    52.4%     -------tgtgtgtttcaaactaaatatcatgggtagattttttccaacctctttgaaggtaa-agtgtgcttaagtgcat--------------------tgata------tgtaatgg-attgaggcatttttttggctgagtttatgaa---------aagtgaaaaacggttggaaaattttcagcgaatgcctttattgttaagggttttagggt-----tataatgaaaataaagaatggctattttactgtg-----------------    
22 Cklu_A_G_2_M6_F7    52.4%     -----aatatatttaaaaataaaaagaaatagttaaatatttttccaaccgacttctaaaata-aaaatacctctattcat--------------------ttaaa------tacaatgt----ttgaggctttttttatgatgattttgaa---------aaataaaaaacggttggaaaaatttcgaacaaactctttattgccaatgtatttagggt-----tataataaaaataaagaatggctaatttacattg-----------------    
23 Cklu_A_G_4_M6_F7    50.0%     -gtataaatgaaaagaatacggaaaatttaatactttaatttttccaacctcataataaggta-aaagtggtgtaatgtta--------------------tcaaa------tcactagc-attacaccactctttatatacattttataaa---------atatgaaaaatggttggaaaaatttcaacgaaagcctttatttatacggttttaagtaa-----tataataaaaataagaaataggcattttacatta-----------------    
24 Cklu_A_G_5_M6_F7    50.2%     actgtgtataaaaaataaattatatgaaaaagtcattatattttccaacctcaattccaact--aaaagtgctgcgtccgt--------------------tgaaa------tccaatgg-attacagcatttcttctatgtgatattcaaa---------aaatcaaaaatggttggaaagattttaataaaaggctttatctatggtggtttaaagga-----tataataaaaataagaaatggctattttacgtta-----------------    
25 Ctet_A_G_4_M6_F7    57.1%     -----cttatagtgttatgagataaaatataaataaaagttttcccaggtgacttcaaatgaa-aatatagcttagagtct--------------------tgatt------tataaggg-gttacatactatttttaaatgtgatttttca---------aaagttaaatcgcctggtaaatttttatggaaatgttgaaatatcaatggttttatggt-----attcttaattttaagaaaccttgattttacagtg-----------------    
26 Ctet_A_G_5_M6_F7    58.0%     -----tgtacaggggaagacttgatattataaataaaagttttaccaggtgattttaaatagg-aatatgctgtaagatat--------------------tgatt------tataaggg-tttatatcctattttgaaatgtagtttttca---------aaagttaaatcgcctggtaaatttttatggaaatgttgaaatatcaatggttttatggt-----attcttaattttaagaaaccttgattttacagtg-----------------    
27 Cbot_P_G_2_M6_F7    48.6%     ------gtgtataacttaactagaatactaaacattatattttaccagcaataaatttatat--gaaacgccttaatcaat--------------------tgaaa--------ttacaggtctaaagtgacctttaaaaatttttattaaa---------atttgacaaacggctggtaaagtttccttaaaaccttgaagtttcaatgccttaatggt-----attattgattttagagaatggctattttactgtg-----------------    
28 Cbot_D_G_2_M6_F7    47.2%     ------gtgtataatttaaatagaatagtaaatattctattttaccagccataaatttatat--aaaatcccttaatccat--------------------tgaaa--------ttactgggctaaggttgccattgaaaatttttattgaa---------atttcacaaacggttggtaaagtttccttgaaaccttgaagtttcaatgccttagtggt-----attattgatttaagagaatggctattttactgtg-----------------    
29 Cbot_D_G_3_M6_F7    47.2%     ------taaagtaagttagctataatattaagcattctattttaccagccataaatttatat--aaaatcccttaatccat--------------------tgaaa--------ttacagcgctaaagtgaccttttaaaaattttctgaaa---------attttataaatggctgggaaagtttcattgaaaccttgaagtttcaatgccttaatggt-----attattgattttagagaatgaggattttactatg-----------------    
30 Csac1_N_G_2_M6_F7   51.0%     ------ccaaggttattatttcttatttaaacttaaagtttatcccaggcataaagaaagata-aattctattaatgtaag--------------------taaaa-------ctgaggc-cttaagaagaattttatgaatattagctaaa---------attcataaaacggttggtaaatttttgcgtgaaagttgattctaagagggatgaatggt-----attatttattttaaggaatggctattttgctat------------------    
31 Csac1_N_G_4_M6_F7   47.3%     ----------gtggttttataattcaatatttctaaatttcatcccagccataaaacaagaaa-aatttcatgaaagtcgg--------------------tgaaa-------ataaggc-ataaagaagaactttttgagtggtagctaaa---------attcataaaacagctggtaaatttctatgaaaaagttgattctaagcggaatggatggt-----attattgattttaaggaatggctattttgctatg-----------------    
32 Cdif_B_G_8_M6_F7    47.2%     -----tttctataatgtatttagattatatagagaatatttatcccaagttaattaattag---aattagtttaaagctat--------------------tgaa-------------------atatagatattttatatcttatatatat---------tttctaggattagctgggataaaaaatctgtatattagtgttttcagtgtatttaaggg-----aattatatttttaagaagtactgattttaaagtg-----------------    
33 Elim_A_G_1_M6_F7    43.1%     ------cgaatcctcagaagacctttttctgtagttctgttttaccaggcacagaaaatttta-aaa---agtcaaaatcc--------------------tttta------aacaaaag-gtttgagcgccatttgaaagaagaattgacg---------aaaatctctgcggctggtaaatttgtagagaaatggcttgaaatcaagggtcttagaga-----atataaatagaggaagaatggcttgattattatg-----------------    
34 Cbot_D_G_4_M6_F7    45.1%     -----aatatacatttgtaatttaagacaagctttattattttaccaggcaattattttaatgaaatcctattaaacctag--------------------ataaa------tacaagga--ttatatataatagaataggttgttatcaat---------attataaaatcacttggtaaaatagtaataatatgttactattactgtattagagcgat-------tttattattttaagaatggcttattttcaatg-----------------    
35 Caut13_D_G_2_M6_F7  40.7%     ------atcgggagcaaatggtgaggatttaataatataatttaccaggcaa------------aaacaaatttatatcta--------------------cgaaa------aacaaggt-gtaatgcggattaacataaatatatttaaaaaattaatttaagttgagggtgcttggtaaatttttaaggatgtgttacactaactataatgaaagcat------tatcttaatataagaagtggcttttttcttaggg----------------    
36 Bcoa_A_G_6_M6_F7    39.7%     -----gggagatggagaatcgatatttttatgactcactttttcccaaccgaat----------aaatacggcacaaccgg--------------------cgatcacttggtataaaaggcttctgagggaatttggatggacatatcaaa---------aaaacgataacggttgggaaaaaacaaac--aatccacttgtaccaaagtctctagctg-----aggtatacttgcagtaagtgttgaaaatactggg-----------------    
37 Cbot_M_G_6_X_F7     34.2%     --------------tataatacaaaacaaaagcttaatatgattttaatacaagtatataaca-aatattcttcttattgtgcttatttaaatttaccttatgaggttcttatacgaggaaataatgaagatgaatttatggataatttaat---------aaa------------ggagataatggagttagattctatagtacaaaagagttcctcat-----aatttctatagtatataataattagtgtatat-------------------    
38 Elim_A_G_2_M6_F7    33.6%     ---------------aatcctgaccattaaatccgatgacgtcgtcggccgtgttgccgcttacgaagccattgtcaaggg--------------------tgaaaacattccgaaaccaggtatcccagaatctttcaaggtactcatgaa---------ggaattccagagtctgg----------------ccctggatgtgcagatcctcaatgacgacgaagtcgtcgaaattctggacggtgactttgcagacgatccagtcgaagagct    
   consensus/90%                 ..........ssssssssssssssssssssssssssssssssTsCCAussssssssssssss..AAsssssssssssssss....................Tsuss........ssAsss.sssssussssssssssssssssssssss.Au.........AsssssssAssussTGGsAAAsssssssssuussssTssssssssuususssssAssss.....sssssTsssssTuuuuAATusssAsTTTussss..................    

MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown