Reference sequence (1): Plum_A_G_6_M2_F6 Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . ] 200 1 Plum_A_G_6_M2_F6 100.0% -attttgac---------------ccttt----tttaacggcaaatttta----------atttattgatttttaagtaaatattgtttatcccacaaaaaagggt-----tttttattttttatcatggttgctctttaacattcaataggttggggttaatatgtaacaa---------------------------- 2 Pasy_G_9_M2_F6 73.5% -atttttac---------------ccttt----ttttgaggtgaattata----------actaattgattttatagtaaaattaattatcccttataaaaagggt-----ttttcactttttaacagttatgctatttgaaaatcaacaggttagagttaatatgtaaca----------------------------- 3 Pasy_G_2_M2_F6 66.2% -gttgtaac---------------ccttt----ttttgcggtaaatcgta----------acattttgatttatattggaaataaattgttgcttataaaaagggtt----ttttcactttttattactatcgctctttaataatcagcgggttaacgctaatatctaac------------------------------ 4 Ddad_C_G_4_M2_F6 51.8% -cttttgac---------------cctt-----tttttcgccccgtgata----------actcgttgatttttaatgatgataaaggtgggttttaaaaaagggtt----tcacgacccaaaacacgactttccctttcaacatcaagccataagcgataaattgctaca----------------------------- 5 Dzea_A_G_3_M2_F6 48.9% -gttttgac---------------ccttt----tttttcactccgttata----------actcattgatttttaatgacgataaagaacggttcaacaaaagggtt----tcgcagggaaaaacgctatttttccttttcacatcaagccataagcgataaattgctacg----------------------------- 6 Ddad_B_G_2_M2_F6 56.6% -gttttgac---------------cttt-----tttttcgcctcgttata----------actcattgatttttaatgacgacaatgatcgacgttaaaaaagggc-----tttccaggaaaaacccagatttccctttaaaaatcaggtaataggcgataaattgctacg----------------------------- 7 Ddad_A_G_1_M2_F6 62.0% -gttttgac---------------ccttt----ttttgcggccagttcta----------acgtattgatttttaataccgcaatctggccgccagaaaaaagggg-----ttttccggaaaaacggcggtttttctttaacaatcaggtgataaacgataattcgctacag---------------------------- 8 Ddad_C_G_5_M2_F6 63.2% -gttttgac---------------ccttt----ttttgcggccagttgta----------acgtattgatttttaatacagcaatctggccgccagaaaaaagggt-----ttttccgggaaaacggctatttctctttaacaatcaggtgataagcgattattcgctaca----------------------------- 9 SERR1_G_1_M2_F6 54.4% ----tgaac---------------ccttt----tttttcgacatgattta----------acttgttgattttaaacatgctgaatgggcaggctgaaaaaagcct-----ttttgggggaatcctggtgttactcttcaataatcagctgattagcgctaatcttcaacggtg-------------------------- 10 Pcar6_E_G_7_M2_F6 58.8% -gttctgac---------------ccttt----tttggcgaccagctgca----------agctattgatttttaattgcggttggtcgccttaataaaaaggatt-----ttttcgcaataaaatgaatattctctttaacaatctggtggttagcgtaaaaacctaaca----------------------------- 11 Etas_A_G_4_M2_F6 50.0% -gttttaac---------------ccttt----tttttccgctaacgcta----------acctgttgattttaggtggcgttagcggggcgtcttaaaaaaggg------ttttatggcaaatttgaggtttttacttgttttatagcgggttagtctgttttattaaca----------------------------- 12 Epyr1_A_G_6_M2_F6 48.9% -gttttgac---------------ccttt----tttttcggctaacgcta----------acctgttgatttcaggtggcgttagcatagcggtttaaaaaagggt-----tttactgcgcattttaggtttttaacttgttttatagcgagttagtctgctttactaacgg---------------------------- 13 Ypes_J_G_2_M2_F6 53.7% -gttttgac---------------cctat----ttttttagctactgcta----------actcattgattttacattgtggttatcggtggtctaaaaaaagggt-----tttttccccattagcgaaataagtattttacaaacaggatgttatcgtattatcttac------------------------------- 14 Ypse_D_G_3_M2_F6 37.5% -gtttcagg---------------gcgttggtacagcagatgataaagat----------cacaataataactcatggggattcttagcctattcacatcaggggcgtca-tttttaccctttggcgaaagagttattttataaacagtttgttacccgtattatcttact----------------------------- 15 Ypse_B_G_4_M2_F6 37.2% -gtttcagg---------------gcgttagtacagcagatgataaagat----------cacaataataactcatggggattcttagcctattcacatcaggggcgtcattttttaccctttggcgaaagagttattttataaacagtctgttacccgtattatcttact----------------------------- 16 Ecol_AY_G_3_M2_F6 43.4% agattgaagaaataccaaaccgacccttt----ttctaggttgtaatgta----------actcattgattttcttattgctattttgaagtctggaaaaagggtt-----tgaatctgcgattttgtaagttttaacagtaaatcaatcggatagtctgctattattcca----------------------------- 17 Ckos_A_G_10_M2_F6 40.4% ggattaaaacagagcgcaatatacccttt----tttatttcatgttacta----------acttattgattttattttatatatataacttgggtgaaaaagggtc-----tgacaggaagacgttgcgtttttcttcaataaatcaacgtgattgtctgatattattcc------------------------------ 18 Ecol_Z_G_2_M2_F6 39.4% ggtgaaaac---------------cctat----ttttggaggtgaaggta----------agttgttgataattagtgctgctggaaggtaaggataaaaaagggt-----gctgcaggagaatgggatggttttgctttattaacaacgggctaaacgtgtagtatttga----------------------------- 19 Efer_A_G_3_M2_F6 40.4% ggtccagac---------------ctttt----ttttgatgatgatagta----------agttgttgataattaatgctgcgggaaggtaaggataaaaaagggtt----gcagcaggaaaatgagatggttttgctttattaacaacgggctaaacgtgtagtattt------------------------------- 20 Xalb_A_G_6_M2_F6 44.9% -gttctgac---------------ccttt----tttcttaagaccaaacc----------caccaaggaaaaacaaacacttagcagccgccccagaaaaaggggt-----tggctgcttttctttatgcgtttatctttcaagtcaaagacttggataatagaacgccta----------------------------- 21 Xcam_0H_G_2_M2_F6 44.9% -gttctgac---------------ccttt----ttcccaagcaggaaagg----------gccgctttgaaatcaatcacttggcaggcaccctgtgcgaagggt------gcctgcctttatttcttggcttttctttagatatcaatggattggatgaattctgatctt----------------------------- 22 DELF_G_3_M2_F6 47.1% -gttctgac---------------ccttt----ttctggcggcctgaaga----------ctgccttgtaaatcaacagcttggcggatgccccggaatttggggt-----gtttgcctgctggaggtgaaagctctttcaaaatcaatggattggggaattttttgcctt----------------------------- 23 Adie_A_G_6_M2_F6 50.7% -gttctgac---------------ccttt----ttttgattccaattaat----------actttccgaaaatcaataacttacgtcacgctccaaaatttggggt-----gtggcgcttctttttagccttgttctttaaaaatcagggagttagattcgtttggttcta----------------------------- 24 Helo_A_G_1_M2_F6 52.9% -gttttgac---------------ccttt----ttcgggagcctctgttg----------aggcccagtaaatcaatgagttagcgccgcttcctagaaaagggtg-----tggcgctttcttttcacgaatgctctttaacaatcagctggttagctatgataagctctt----------------------------- 25 THIO3_G_2_M2_F6 42.3% -gttttgac---------------ccttt----ttccgggcgcacccatg-----t----tgcgctcggaaatcagtgagatacgccatccctccggcaaagggtg-----aaagccgatcactacgcaatagttctttaacaatcagcgatatagaatcaacatgctcaa----------------------------- 26 Sput_B_G_2_M2_F6 41.2% -----------------aaaatacccttt----ttttcgcaccaccgcca----------aaccctgataaaccgcggcttagcgcttaggcataaaaataaaggta----tttttgctaaaaaggtcaatagctctttaataatcagatgcttaatggtatttttccatt----------------------------- 27 Dind2_A_G_1_M2_F6 43.4% -gttttgac---------------ccttt----tttcttgatgcatggta----------acgtctagtatttaaaccacttggccagcaacctgaaattatggt------tgctggccatttttaggcggaacatctttaccacgggttacttcctgcgctacagttata----------------------------- 28 Veis_A_G_3_M2_F6 44.5% -gttttgac---------------cctttt---ttcctgcgtgtgccagt----------tttccaataaaatcaacgacttgcaggttcccctcagaaatgggg------gcgccgggaagcgtctgtttttttgtttgagaatcaatgggttatggtggttttgggata----------------------------- 29 Taue_A_G_2_M2_F6 54.0% -gttctgac---------------cctttt---tcttgctgccaacgcca----------acccattaataattaataggttggcgttatgcgtaaaaataggga------agtagctggaaaataataaaagctctttcacaatcagtatattagatttaaattgttacg----------------------------- 30 Bglu_A_G_1_M2_F6 36.2% ctgctgaac---------------ccttt----tttcggcagaatgcgcg-----a----ggggctgcaaaatcaatgggttagcgagaggcgggaaatttggggg-----gtgcgaggtgtcgggcgggaattggtttttgaatcaagggggtaggtgggtttttgttca----------------------------- 31 Dmag1_A_G_3_M2_F6 44.4% -gttttgac---------------ctttt----ttttgtttcgtttaaaa----------aactatttaattacaacccattgcttgtcggccaggaaaaaggta------tttgggttaaatagtccaaaactcgttatgattgctgtattttcagcaaattgtgtcca------------------------------ 32 Dzea_A_G_1_M2_F6 46.7% tttttatac---------------ccttt----tttccgccgctattttc----------gatacttaaaaatcaatcagttaccgatagccgaaaaaaaagggtc-----tgacggcgaaaatcgacaattgcaggtaggaatacaacgggttagagtcaacgggctaca----------------------------- 33 Ddad_B_G_4_M2_F6 43.8% ccgctatac---------------ccttt----tttcaaccgtctttttc----------ggcatttaaaaatcaataagttaaaggtagccgagaaaaaagggtc-----taacggtgaaaatcgccaattgcgggtcagaatacaaagggttagagtcaactcgctacg----------------------------- 34 Paer_F_G_5_M2_F6 45.3% gcttccgac---------------ccttt----tttcggacgatttctta----------cgcccttataaatcagcaagttacgagacctcgaaaaaagagggtt-----tctggcgggaaaaactcggtatttctttttccttcaaatggttataggttttcggagcta----------------------------- 35 Paer_E_G_1_M2_F6 44.5% gcttccgac---------------ccttt----tttcggacgatttctta----------cgcccttataaatcagcaagttacgagacctcgaaaaaagagggtt-----tctggcaggaaaaactcggtatttccttttccttcaaatggttataggttttcggggcta----------------------------- 36 Paer_D_G_2_M2_F6 45.3% gcttgcgac---------------ccttt----tttgggacggtttctta----------cgcccttgaaaatcaaagacttacaaagcctcgtaaaaagagggtt-----tcaaactgggaaaaccctgtatttctttttccttcaaatggttataggttttcgcggcta----------------------------- 37 Pstu_0C_G_7_M2_F6 40.7% 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aatac-------------------ccttta---tttttgctctttaaaaa----------attagttttaaaacaaaaagttacaacagttgatatttagaaaggt----------------------------------aaaagtacgtttttttacctatctgcctgttgtaacttatttttttgcagataagctatt 42 Mnit_A_G_1_M2_F6 28.9% -aatttaac---------------cattc----tttttagttctttaaaa-----a----aacatttaattattaataagttacatg----------------------------------taatcgttttatcattcataaaacctgaagaatgagagtaaatgattgttgtaacttattttttttgcgttaaacttca 43 Gana_0UM_G_3_M2_F6 36.8% -cttttaatcaataac--------ccttt----tttggagatactaaaaa-----a----tctatcaaaatatcaataggttataaaacacatctaaaaaagggtt-----tttatcttaaaatgttctttaacaattgactttccttatatcataaggtattcgtgtcta----------------------------- 44 Aact_B_G_2_M2_F6 36.7% -tttttaat---------------tcccctttatttgcacaataaaaaaa----------tcccctttaaaaacagtatattaaaaacacaatctataaaaaggat-----tttcactttaaaatacgctaacaacttggtatatcagctattttcagttagaatgccta------------------------------ 45 Aple1_C_G_1_M2_F6 39.2% 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