Reference sequence (1): Mvul_G_4_X_F4 Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : ] 355 1 Mvul_G_4_X_F4 100.0% ttagatttttgttttttatttg-gttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattgttttgtatatt---tggatgtgtttgattatggagtttt---------tttgaagtttttagttatttgtagttgtttttagaaatcc--------acggttgattaagtgtgttttatgtttttattttctgtttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaaggaaaggggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaatatt-ataatgaaataaggaaaattaccct-- 2 Mvul_A_G_4_X_F4 100.0% ttagatttttgttttttatttg-gttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattgttttgtatatt---tggatgtgtttgattatggagtttt---------tttgaagtttttagttatttgtagttgtttttagaaatcc--------acggttgattaagtgtgttttatgtttttattttctgtttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaaggaaaggggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaatatt-ataatgaaataaggaaaattaccct-- 3 Mvul_A_G_10_X_F4 93.1% ttagatttttgttttttagttg-gtttttgttggtttctgagggttggtttgttttattattttgtatatt---tggatgcttttatttatggagtttt---------tttagagtttttagttatttatagttgtttttagagatcc--------atggttgattaattatattttatgtttttgttttctatttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattacctt-- 4 Mvul_G_10_X_F4 93.1% ttagatttttgttttttagttg-gtttttgttggtttctgagggttggtttgttttattattttgtatatt---tggatgcttttatttatggagtttt---------tttagagtttttagttatttatagttgtttttagagatcc--------atggttgattaattatattttatgtttttgttttctatttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattacctt-- 5 Mvul_A_G_12_X_F4 93.7% ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctaagggttggtttgttttattgttttttatatt---tggatgtgtttgattatggagattt---------tttagagtttttagttatttgtagttgtttttagaaatcc--------acggttgattaagtgtgttttttgtttttatattttatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaagaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaacgta-ataatgaaataagaaaaattgtcct-- 6 Mvul_A_G_9_X_F4 91.5% ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtatttaattatggagattt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttaaaaatcc--------atggttgattaagtgtgttttttgtttttatgttttatttat------tgttgttttttaaataaaagttcgaattgttttgttatagggtt------tataaagaagaggggttatctatgggtagaagttttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgccct-- 7 Mvul_G_9_X_F4 91.5% ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctaaggggtggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtatttaattatggagattt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttaaaaatcc--------atggttgattaagtgtgttttttgtttttatgttttatttat------tgttgttttttaaataaaagttcgaattgttttgttatagggtt------tataaagaagaggggttatctatgggtagaagttttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgccct-- 8 Mvul_G_2_X_F4 91.2% ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctgagggttggtttgtttaattgtttcttatatt---tagatgtgtttgattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttatagttgtttttagaaatcc--------acggttaattaagtgtgttttttgtttttgttaattatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgtcct-- 9 Mvul_A_G_2_X_F4 91.2% ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctgagggttggtttgtttaattgtttcttatatt---tagatgtgtttgattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttatagttgtttttagaaatcc--------acggttaattaagtgtgttttttgtttttgttaattatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgtcct-- 10 Mvul_A_G_7_X_F4 91.5% ttagatttttgttttttatttgttttttagttggtttctgagggttggtttgttttattattttatatatt---tggatgtatttaattatggagattt---------tttagagtttttaattatttgtagttgtttttagaaatcc--------acggttaattaagtgtgttttttgtttttgttaattatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaagaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaataccagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaagattgccct-- 11 Mvul_A_G_21_X_F4 91.8% ttagatttttgttttttatttg-tttttagttggtttctaagggttggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtgtttgattatagggattt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttaaaaatcc--------atggttgattaagtgtgttttttgtttt------ctatttat------tgttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggagttatctatgggtagaaaaattatagtgtagaaaaatataaatataagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattaccct-- 12 Mvul_A_G_14_X_F4 90.9% tagatttttgtttttttatttgttttttagttggtttctgaggggtggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtatttaattatggagtttt---------tttagagtttttaattatttgtagttgtttttaaaaatcc--------acggttagttaagtgtgttttttgtttttatattttatttat------tgttattttttaaataaaagtttggattgttttgttatagggtt------tataaagaaaagaggttatctatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatataagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattaccct-- 13 Mvul_A_G_20_X_F4 90.6% ttagatttttgttttttatttg-gtttttgttggtttctaaggggtggtttgtttaattattttgcatatt---tggatgtatttgattatggagtttt---------tttagagtttttaatttattgaagttgtttttagaaatcc--------atggttgattaagtgtgttttttgtttttatttgtttttagt------tgttgttttttaaataaaagtttggattgttttgttatagggtt------tataaagaaaagaggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaatatt-ataacaaaataagaaaaattatcct-- 14 Mvul_A_G_16_X_F4 87.1% tatattttgtgttttttatttgttttttagttggtttctgagggttggtttgttttattattttttatatt---tagatgtatttaattatggagattt---------tttagagtttttagttatttacagttgtttttagaaatcc--------atggttgattatttgatctatttatttttattgattatttgc------agttattttttaaataaaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatctatgggtagaaatcttatagtgtagaaaaatataaatatcagtaa-aaacatt-ataatgaaataagaaagattgccct-- 15 Mvul_A_G_8_X_F4 90.9% tgaggtttctgttttttatttg-tttttagttggtttcgaatgggtggtttgttttattattttgtatatt---tagatgtgtttgattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttagaaatcc--------atggttgattaattatattttatgtttttatgttttatttat------tgttattttttaaatagaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatttatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacattaataataaaataaaaaaaattatcct-- 16 Mvul_G_8_X_F4 90.9% tgaggtttctgttttttatttg-tttttagttggtttcgaatgggtggtttgttttattattttgtatatt---tagatgtgtttgattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttagaaatcc--------atggttgattaattatattttatgtttttatgttttatttat------tgttattttttaaatagaagtttgaattgttttgttaaaaggtt------tataaagaaaaggggttatttatgggtagaaattttatagtgtagaaaaatataaatattagtaa-aaacattaataataaaataaaaaaaattatcct-- 17 Mvul_A_G_6_X_F4 84.6% tatattttgtgttttttatttg-gtttttgttgattttgaaggagtggtttgttttattattttgtatatt---tggatgtatttaattatggagtttt---------tttagagtttttaattgtttgtagttgtttttagaaatcc--------acgattaattacttgatttacttatttttattaattatttat------tgttgttttttaaataaaagttcgaattattttgttatagggtt------tataaagaaaaggggttatttgggggtaggataattatggtgtggaaaactataaatataagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattaccct-- 18 Mvul_A_G_17_X_F4 70.6% catctttattgcaaactacgtc-tatataataattatccttggcatg--tatttttatcttgttgtttgtt---tttgtttttttgtgtttttagtttttggtttagatttttgttttttatttgtttttagttggtttctg--------------agggttggttaattatattttatgtttttatattttatttat------tgttgttttttaaataaaagtttgaattattttgttatagggtt------tataaagaaaaggggttatttgggggtaggataattatggtgtggaaaactataaatataagtaa-aaatatt-ataatgaaataagaaaaattaccct-- 19 Mjan_A_G_16_X_F4 58.6% ctgatatcattatttttaacct-tttttatctaatttctaagggtagcttattttaaaaattttatttatt---tggatttgttaaattatagggattt---------ttaaaaaattctacttaattgtttttattttgagatttct--------ccaatgattaatttttattttgaaaatcaaatattttaaaaa--ccaagtttataccatagagaaaagtttaaa---tattggttaatggta------tataaataaaaggtgaaacctacccatcggtaaaatgtgg-gtagtaaaatataaatatcagaaa-gattat--aaaataaatcatctgatatgaccgcct 20 Mjan_A_G_17_X_F4 54.9% atttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggttagctggtttgattgtttaaaatatt---tgagtttattgaattattcagattt---------ttaaaaattaggattaattaggtaagtaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct-- 21 Mjan_G_17_X_F4 54.9% atttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggttagctggtttgattgtttaaaatatt---tgagtttattgaattattcagattt---------ttaaaaattaggattaattaggtaagtaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct-- 22 Mjan_G_14_X_F4 55.5% agttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggtttgctggtttgattatttagaatatt---tgagtttattgaattattcagattt---------ttaaaaattaagattaattaggaaaggaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatgcttagttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct-- 23 Mjan_A_G_19_X_F4 55.5% agttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggtttgctggtttgattatttagaatatt---tgagtttattgaattattcagattt---------ttaaaaattaagattaattaggaaaggaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatgcttagttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct-- 24 Mjan_A_G_12_X_F4 53.7% agttattaattagttcaaagga-tttttatttaatttctaagggtttgctggtttgattatttagaatatt---taagtttattgaattattcagattt---------ttgaaaataaaaattaaataattatctaaataagatttct--------ctaacagacaagttaaatttttgaatttaaaaagataaaaatgcttagttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttacccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct-- 25 Mjan_A_G_18_X_F4 55.8% atctatttcttcatttgagaat-tttttatttaatttctaagggtttgctggtttgattatttagaatatt---tgagtttattaaattatttagattt---------ttaaaaattgagattaattaggtaagtaaataagatttct--------ctaactaataagttaaatttttgaatttaaggagataaaaatgcttagttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaaatatattatgttgtgaatgattgccct-- 26 Mjan_A_G_3_X_F4 55.2% ctttatttctttatttaaataa-tatttatttaatttctaagggtttgctggtttgattgtttagaatatt---taacttaatcaaattatttgaattt---------ttgaaaattaggattaattaggcaagtaaataagatttct--------ctaacaaataagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatactctgttttagtaaagagataaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaaatatattatgttgtgaatgattaccct-- 27 Mjan_G_10_X_F4 54.3% aattatttctttatttaaataa-tatttatttaatttctaagggttagctgatttgattgtttaaaatatt---taacttaattaaattatttagattt---------ttaaaaattaagattaattaggtaagtaaataaaatttct--------ctaacaaataagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatgctcagttttattaaagggagaaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct-- 28 Mjan_A_G_10_X_F4 54.3% aattatttctttatttaaataa-tatttatttaatttctaagggttagctgatttgattgtttaaaatatt---taacttaattaaattatttagattt---------ttaaaaattaagattaattaggtaagtaaataaaatttct--------ctaacaaataagttaaatttttggatttaaaaagataaaaatgctcagttttattaaagggagaaaattttaaa------tactaaaaggtt------tatattgtaagatggttatttatccttagaaaaa-tatggtatagaaaagcttaaatattaagagtgatgaagtatattatgttgtgaatgattgccct-- 29 METH32_G_1_X_F4 53.1% tggtatttgttaatttagagga-tttaagttcaatttctaagggtctgtaagtttgattatttggaatatt---taggttcattaaattatttagattt---------ttaaaagttaagattgaatagtaagttaaatgagatttct--------ctaactaataagttaaatttttaaatttagaaagataaaaatgctctattttattgatgatagaaaagcttata------tagtgttggatt------tataaataaaggatgttatttacccttagaaaaa-tatggttccgaaaagcttaaatattagaag-agtgattaaaattatattgtcgatgattgccc--- 30 Mthe5_A_G_7_X_F4 41.9% tcggggtcctttcgttcagtcg-tttatgagccatttttcagcatcccattataataacataatgttattt---taagcttctttcaggattaaaggtt---------ttattatcaacctgatggttttttatcctgccaaaattct--------ttttaaattgatttaaatactttaaatgtcttatttatggat--------------------------tttaataccttctgttaagtcgtctatccatataaatagaatgcattttctg-ggatcgacaaatttatatgtctgaaaggagaaatttcaa----agcgatagaggtcaaatgaagaaaaaatccgccct 31 Mthe5_A_G_16_X_F4 42.2% ttggagcccattcgtccagtcg-tttatgagccatttttcagcttcctgttataataacttgatgttattt---taagcttctttaaggattagaggtt---------ttaatatcaattatatgattatttatcttgctaaaattct--------ttttagattattttaaatagtttaaatctcttatttatggat--------------------------tttaaggccttctgttaagtcgtctatccatataaatggagtgcattatcag-ggatcgacaaatttatatgtctgaaaggagaaatttcag----agcgatagaggccaaataaagaaaaaattggccat 32 Mtau_G_16_X_F4 42.2% ttggagcccattcgtccagtcg-tttatgagccatttttcagcttcctgttataataacttgatgttattt---taagcttctttaaggattagaggtt---------ttaatatcaattatatgattatttatcttgctaaaattct--------ttttagattattttaaatagtttaaatctcttatttatggat--------------------------tttaaggccttctgttaagtcgtctatccatataaatggagtgcattatcag-ggatcgacaaatttatatgtctgaaaggagaaatttcag----agcgatagaggccaaataaagaaaaaattggccat 33 METH35_G_5_X_F4 41.7% --------tcttttttcagaga-ttttaaacagatattactggatcgtttattaagggttcttcatgtattacataagtttaatctaata-------tt---------acaacaacttcaatttatttctattgatctttttgattcttatttctactgtagcatcatatttaattctcaaagtaaatttagggacatttaatattttgttttgttcaaaaaaattca------ttcaattaatcgttgatccatataaa-ataatctgtaaattgtggatggataattttaagtgtgatattggccaaaatataa----gctgtatcatgggaaataggcgaaatttcggccct consensus/90% ssssssTsssssssTssAsssu.ssTsTssssuuTTTsssAGGusssssTsuTsssAsssTsTssssTuTT...TuuuTsssTTsuAsTATssuussTT.........TTsusAssssssAsTsusTsusssssssssTsAuAssTCs........ssusssusssAssTusuTTsTssussTssssssssTusssAT......ssTTussssssssAsAuAAsTTsuuu......TusTAsussGTs......TATAssssuuusssGTTATsTussssTsGAsuss.TssuGTuTsuuAAAusssAAATsTsAu....uussAss.AsussusussusuuAsuATTsssCs.. |
MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown