Reference sequence (1): Tsp_A_G_16_X_F3 Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% and property |
1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . ] 235 1 Tsp_A_G_16_X_F3 100.0% tatttccctatgtgcaaactaaaagttgtttatgaagtttctcattgggaagcttattttaaatttaggtttacgggaaaacgtcccgacccaaaacggggtgtttcgggaagcttccctatagggaagtttcagaagtttccaatgtgtaaatttgtgtgctagggcagttttgcagacttcttga-aggaaaaagcattaaacatataaaccatgcccgagtaaaacatttcg 2 Tsp_A_G_15_X_F3 86.8% tgttttctttaaggaaaactaaaagttgtttatgaagtttcttgacgagaggattattttaaatttaggtttacgggaaaacttcccgtcttaaaacggggcgttccgggaagcttccctactgggaagtttcagaagtttccaacgagtaattctgagtgctagggcagttttgcagacttcttgc-aggaaaaagcattaaacatataaaccacacccgagtaaaacatttcg 3 Tsp_A_G_11_X_F3 80.9% gttttccttgaaggaaaactaaaagttgtttatgaagtttctcgttgggaaggttattttgaaaagaga-ttacgggaagaattcccgacccaaaacggggcattctgggaagattccctggtgggaagtttcagaagcttccaacgtgtaattttgagtgctagggcagttttgcaggcttcttcaaaaaattaaacgttaaacatataaaccccacccgagcaaaacaattcg 4 Tsp_A_G_8_X_F3 85.1% gttttcccattaggaaaactaaaagttgtttatgaagtttctcgtcgggaaggttattttaaaaagaga-ttacgggaaaaattcccgacccaaaacggggtgtttcgggaaagttccctatcgggaagtttcagaagtttccaacgggtaaatttgagtgctaaggcagttttacagacttcttgataaaattaaacgttaaacatataaaccacacccgagtaaaacaattcg 5 Tsp_A_G_9_X_F3 85.5% gttttcccattaggaaaactaaaagttatttatgaagtttctcgttaggaagcctattttaaatttaggtttacgggaaaaattcccgacccaaaacggggcattctgggaagcttcccagtagggaagtttcagaagcttccaacgggtaaatttgagtgctagggcagttttgcagacttcttgataaaaataaacgttaaacatataaaccccacccgagcaaaacaattcg 6 Tsp_A_G_13_X_F3 85.1% atcttccttaaagccaaactaaaagttatttatgaagtttctcgttgggaaggttattttaaatttaggtttacgggaaaaattcccgacctaaaacggggtgtttcgggaagtttctcgataaggaagtttcagaagcttccaatgtgtaattttgagtgctagggcagttttacagacttcttgataaaatcaaacgttaaacatataaacccctcctgggtaaaaaatttcg 7 Tsp_A_G_17_X_F3 83.3% gttttccttaaaggaagactaaaaggtgtttatgaagtttctcgacgggaaggttattttgaaaagaga-ttacgggaaaacttcccgacccaaaacggggtatttcgagaagcttcccaattgggaagtttcagaagcctccaatgtgtaaatttgagtgctagggcagttttgctggcttcttgc-aggaaaaagcgttaaacatataaacccctcctcggtaaaacaactcg 8 Tsp_A_G_10_X_F3 79.1% catgcatacatttgaagactaaaagttatttatgaagtttctcgacgagaggattattttaaaaagaga-ttacgggaaaacgtcccgaccttaaacggggtgtttcgggaagcctcccgtatgggaagtttcagaagtttccaacgagtaattttgagtgctggggcagttttgccgacttcttgataaaattaaacgttaaacatatcaaccgcgtccgagcaaaacaaatcg consensus/90% sssssssssssssssAuACTAAAAGsTuTTTATGAAGTTTCTsussuuGAuGssTATTTTuAAsssAGu.TTACGGGAAuAssTCCCGsCsssAAACGGGGsuTTssGuGAAussTCsCssssuGGAAGTTTCAGAAGssTCCAAsGsGTAAsTsTGsGTGCTuuGGCAGTTTTuCsGuCTTCTTss.AuuAssAAuCuTTAAACATATsAACCssssCssuGsAAAAsAssTCG |
MView 1.60.1, Copyright © 1997-2015 Nigel P. Brown