Seminar: Methoden zur Analyse von RNA Strukturen und Alternativen Spleißformen

Termin der Vorträge (Blockveranstaltung): 26.2.2007
9:30 Uhr (st)
SR 00007 Geb 106

9:30 - 11:45

• Martin Recknagel: "RNA Co-Faltung (RNAup)"
• Holger Bertsch: "RNA Co-Faltung (PairFold)"
• Jörg Bruder: "inverse RNA Faltung (RNA-SSD)"
• Joachim Krempel: "inverse RNA Faltung (INFO-RNA)"

13:00 - 15:15

• Dennis Werne: "Multiples Alignment (POA)"
• Kerstin Schmatzer: "Isoformen Rekonstruktion"
• Daniel Schüssele: "Splicing Regulatory Motifs (Rescue-ESE)"
• David Maticzka: "Erkennung von unbekannten alternativen Exons (Uncover)

Anforderungen

• selbständige Erarbeitung des Themas (Literatur, Internet, Wikipedia)
• bei Fragen: Anke Busch, Michael Hiller 
• Zimmer 02/012

    Vortrag:

• Anfertigen von Folien: PowerPoint, Latex
• Abgabe: 14.02.2007
• anschauliche Darstellung (viele Bilder)
• Dauer: 30 Minuten Vortrag
• dient dem Zuhörer

    schriftliche Zusammenfassung auf 2 A4 Seiten

Themen:

• RNAup
• RNA-SSD
• INFO-RNA
• Splice Enhancer
• Multiples Sequenz Alignment
• Isoformenrekonstruktion
• Pfam-basierte Spliceformvorhersage
• Spliceformvorhersage durch Konservierung
  

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